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川牛膝MSAP反应体系的优化及引物筛选
引用本文:文静,马云桐,陈新,周碧乾,王文韬,黄凤.川牛膝MSAP反应体系的优化及引物筛选[J].世界科学技术-中医药现代化,2015,17(9):1860-1865.
作者姓名:文静  马云桐  陈新  周碧乾  王文韬  黄凤
作者单位:成都中医药大学药学院 成都 611137;四川省中药资源系统研究与开发利用省部共建国家重点实验室培育基地 成都 611137,成都中医药大学药学院 成都 611137;四川省中药资源系统研究与开发利用省部共建国家重点实验室培育基地 成都 611137,成都中医药大学药学院 成都 611137;四川省中药资源系统研究与开发利用省部共建国家重点实验室培育基地 成都 611137,成都中医药大学药学院 成都 611137;四川省中药资源系统研究与开发利用省部共建国家重点实验室培育基地 成都 611137,成都中医药大学药学院 成都 611137;四川省中药资源系统研究与开发利用省部共建国家重点实验室培育基地 成都 611137,成都中医药大学药学院 成都 611137;四川省中药资源系统研究与开发利用省部共建国家重点实验室培育基地 成都 611137
基金项目:四川省科技厅科技支撑计划项目(14ZC2156):川牛膝道地药材规范化种植技术研究与推广示范,负责人:陈新。
摘    要:目的:首次对川产道地药材川牛膝表观遗传多样性进行研究,建立并优化川牛膝甲基化敏感扩增多态性技术(MSAP)最佳反应体系。方法:以川牛膝苗期叶片为材料,利用正交试验设计对川牛膝MSAP反应体系中预扩增和选择性扩增中关键影响因素进行考察,建立川牛膝MSAP反应最佳体系。结果:川牛膝MSAP最佳反应体系为:酶切体系(20 μL),300 ng DNA、1.5 μL EcoRI、1.5 μL HpaII或1.5 μL MspI(HpaII);连接体系(25 μL):15 μL酶切产物、1 μL EcoRI adaptor、1 μL HpaII/MspI adaptor、0.2 μL T4连接酶;预扩增体系(25 μL):连接产物1 μL、rTaq酶1 U、引物分别1.5 μL、dNTP 2 μL;选择性扩增体系(25 μL):预扩产物稀释50倍、rTaq酶1 U、引物1.5 μL、dNTP 3 μL,并运用优化后的体系,最终从川牛膝MSAP的256对引物中筛选出有效引物6对。结论:优化后的体系保证了稳定的图谱、清晰的条带,筛选出的6对引物组合特异性好,能够用于后续川牛膝DNA甲基化相关实验研究,同时,为其他药用植物MSAP分析提供了参考。

关 键 词:川牛膝  MSAP  预扩增  选择性扩增  引物筛选
收稿时间:2015/5/20 0:00:00
修稿时间:2015/6/14 0:00:00

Optimization of MSAP Reaction System for Cyathula officinalis Kuan and Primers Screening
Wen Jing,Ma Yuntong,Chen Xin,Zhou Biqian,Wang Wentao and Huang Feng.Optimization of MSAP Reaction System for Cyathula officinalis Kuan and Primers Screening[J].World Science and Technology-Modernization of Traditional Chinese Medicine,2015,17(9):1860-1865.
Authors:Wen Jing  Ma Yuntong  Chen Xin  Zhou Biqian  Wang Wentao and Huang Feng
Institution:College of Pharmacy, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, Chengdu 611137, China; State Key Laboratory Breeding Base of Systematic Research Development and Utilization of Chinese Medicine Resources, Sichuan Province and Ministry of Science and Technology, Chengdu 611137, China
Abstract:
Keywords:Cyathula officinalis Kuan  MSAP  pre-amplication  selective amplification  primers screening
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