生物信息学预测has-miR-186的靶基因与功能 |
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引用本文: | 宋佳希,吴嘉,袁云龙,汪俊军.生物信息学预测has-miR-186的靶基因与功能[J].临床检验杂志,2014(10):765-770. |
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作者姓名: | 宋佳希 吴嘉 袁云龙 汪俊军 |
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作者单位: | 南京军区南京总医院解放军临床检验医学研究所,南京210002;南京军区南京总医院解放军临床检验医学研究所,南京210002;南京军区南京总医院解放军临床检验医学研究所,南京210002;南京军区南京总医院解放军临床检验医学研究所,南京210002 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81271904);国家重大科学仪器设备开发专项资助项目(2012YQ030261)。 |
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摘 要: | 摘要:目的:利用生物信息学的方法预测hsa-miR-186的靶基因与功能,为深入研究其生物学功能提供理论依据。 方法:利用Pubmed检索miR-186相关文章,进行总结分析;用miRbase、NCBI等在线工具分析hsa-miR-186序列及所在基因组特征;用TargetScan、PicTar 及miRanda预测hsa-miR-186的靶基因,结合已证实的靶基因进行功能富集分析(GO analysis)和信号转导通路富集分析(Pathway analysis)。 结果:已有的研究证实miR-186与多种肿瘤发生、发展有关;参与压力应激引起的神经功能改变,并在心血管疾病中表达异常。hsa-miR-186位于人类染色体1p31.1,序列具有高度保守性。hsa-miR-186靶基因功能富集在糖代谢、肾脏发育、视觉功能、神经功能、脂质转运等生物学过程;信号通路涉及前列腺癌、肿瘤信号通路、p53信号通路、黑色素瘤、细胞黏附分子和细胞周期等信号通路。 结论:hsa-miR-186功能广泛,与神经系统发育、细胞增殖与凋亡、糖代谢和脂质转运等密切相关。
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关 键 词: | 微小核糖核酸 has-miR-186 生物信息学 靶基因 功能 |
收稿时间: | 7/1/2014 12:00:00 AM |
Bioinformatics prediction for target genes of has-miR-186 and analysis on its function |
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Abstract: | |
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Keywords: | microRNA has-miR-186 bioinformatics target gene function |
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