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子宫内膜癌坏死性凋亡差异基因的生物信息学分析及预后模型建立
作者姓名:杨紫  汪期明
作者单位:1. 宁波大学医学部;2. 宁波市妇女儿童医院
基金项目:宁波市科技计划项目(2021S158);
摘    要:目的 通过生物信息学筛选影响子宫内膜癌预后相关的坏死性凋亡基因,并构建模型。方法 从TCGA数据库中获得子宫内膜癌及癌旁非肿瘤组织的mRNA测序信息,从FerrDb数据库中获取坏死性凋亡基因,通过R软件筛选匹配得到子宫内膜癌坏死性凋亡差异基因,分别进行富集分析和PPI网络分析,利用Cytoscape构建蛋白互作模块。通过单因素及多因素分析建立预后预测模型,并得到风险评分(RS),建立生存曲线,分析模型中的风险因素与基因的相关性,评估模型效能。结果 共筛选出7个坏死性凋亡差异基因,分别为SPATA2、IFNA1、PLA2G4F、JMJD7-PLA2G4B、STAT6、TLR4、CHMP2A。7个基因在肿瘤组织及正常组织中表达差异均有统计学意义(均P<0.05);随着RS的升高,患者生存时间缩短,且死亡患者增多。生存曲线分析显示与高危组相比,低危组患者生存率较高,高危组的预后较差(P<0.05)。CHMP2A、JMJD7-PLA2G4B、STAT6、TLR4基因随着肿瘤分级、病理分期的增高,其对应的表达量呈现降低趋势,其中TLR4基因与年龄呈正相关(P<0.05)。SPT...

关 键 词:子宫内膜癌  坏死性凋亡  TCGA  预后  预测模型
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