| 基于分子对接与动力学模拟的用于治疗新型冠状病毒肺炎的中药活性成分虚拟筛选研究EI北大核心CSCD |
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| 引用本文： | 刘明皓,Faez Iqbal Khan,肖雨晴,王栩,胡子然,赖大坤.基于分子对接与动力学模拟的用于治疗新型冠状病毒肺炎的中药活性成分虚拟筛选研究EI北大核心CSCD[J].生物医学工程学杂志,2022(5):1005-1014. |
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| 作者姓名： | 刘明皓 Faez Iqbal Khan 肖雨晴 王栩 胡子然 赖大坤 |
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| 作者单位： | 1.电子科技大学电子科学与工程学院610054;2.电子科技大学生命科学与技术学院610054;3.西交利物浦大学生物科学系215000;4.电子科技大学医学院610054;5.电子科技大学计算机科学与工程学院610054;6.黑龙江中医药大学第一临床医学院150006; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(61771100)；四川省科技计划(2021YFH0093)。 |
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| 摘 要： | 本研究旨在从国家卫生健康委员会发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第九版)》重型和危重型药方中筛选可能对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)有治疗作用的活性成分,并通过其与严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)蛋白的相互作用阐释其作用机制。采用国际ETCM数据库和SwissADME数据库筛选3个药方中25味中药所含有的活性成分,使用PDB数据库获取SARS-CoV-2的4种蛋白质的晶体结构,采用Autodock Vina进行分子对接,使用GROMACS进行分子动力学模拟。分子结合能结果显示夏姆比奥纳、甘草素L、木犀草苷和黄芩苷等44种活性成分与SARS-CoV-2的多个靶点显示出良好的结合亲和力,而分子动力学模拟分析显示夏姆比奥纳与SARS-CoV-2的核衣壳蛋白能够更紧密地结合并发挥有效的抑制作用。本研究采用现代技术方法对中药活性成分进行研究,发现夏姆比奥纳是SARS-CoV-2核衣壳蛋白的有效抑制剂,为开发新型的抗SARS-CoV-2药物及其治疗方法提供科学的理论依据。
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| 关 键 词： | 新型冠状病毒肺炎 中药 虚拟筛选 分子对接 分子动力学模拟 夏姆比奥纳 |
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