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华支睾吸虫成虫全长基因表达文库的构建和基因表达谱的建立
引用本文:徐劲,胡旭初,应康,吴忠道,陈守义,谢毅,余新炳.华支睾吸虫成虫全长基因表达文库的构建和基因表达谱的建立[J].中国人兽共患病杂志,2004,20(5):383-386,393.
作者姓名:徐劲  胡旭初  应康  吴忠道  陈守义  谢毅  余新炳
作者单位:[1]中山大学基础医学院寄生虫学教研室,广州510089 [2]复旦大学生命科学院遗传学研究所
基金项目:广东省团队项目《人类基因组计划:模式生物 (人体寄生虫)功能基因组研究》,广东省自然科学基金重点课题“模拟蛋白芯片技术筛选华支睾吸虫特异分泌性抗原的研究”的资助
摘    要:目的 获得尽可能多的华支睾吸虫UNIGENE及全长基因,建立成虫基因表达谱,为华支睾吸虫发育过程中基因表达的规律和功能基因组学研究奠定基础。方法 构建pBlueseript Ⅱ SK全长cDNA质粒文库,先对5’端进行随机EST大量测序,生物信患分析后归并UNIGENE,并对归并的结果进行了3’端的序列测定,根据3’端测序结果,再次进行UNIGENRE归并,对能够拼按上的克隆进行了序列拼接。对预测为完整基因且未测通的序列,进行了引物设计,walking反应测序,将得到的UNIGENE用点样法制备基因芯片。结果 获得5’端有效EST序列4066个,测序结果UNIGENE分析,归并获得1775个UNIGENE,5’端预测的全长基因为377个。共获得测通的cDNA序列277个,其中全长基因198个。目前制备的华支睾成虫基因表达谱芯片含有1775个基因。结论 所构建的华支睾吸虫成虫全长cDNA文库质量较好,采用的技术路线获取全长基因建立基因表达谱的效率较高。

关 键 词:华支睾吸虫  基因表达谱  生物信息学
文章编号:1002-2694(2004)05-0383-04

Construction of full-length gene expression library of Clonorchis sinensis adults and establishment of the gene expression pattern
XU Jing,HU Xu chu,YING Kang,WU Zhong dao,CHEN Shou yi,XIE Yi,YU Xin bing.Construction of full-length gene expression library of Clonorchis sinensis adults and establishment of the gene expression pattern[J].Chinese Journal of Zoonoses,2004,20(5):383-386,393.
Authors:XU Jing  HU Xu chu  YING Kang  WU Zhong dao  CHEN Shou yi  XIE Yi  YU Xin bing
Abstract:
Keywords:Clonorchis sinensis  gene expression pattern  bioinformation
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