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广东流行的三株登革1型病毒包膜蛋白基因的序列测定与分析
引用本文:田小东,刘建伟,方美玉,蒋廉华,任瑞文,洪文艳,程刚锋.广东流行的三株登革1型病毒包膜蛋白基因的序列测定与分析[J].南方医科大学学报,2005,25(1):54-57.
作者姓名:田小东  刘建伟  方美玉  蒋廉华  任瑞文  洪文艳  程刚锋
作者单位:广州军区联勤部军事医学研究所微生物室, 广东广州510507
摘    要:目的 通过对广东省不同地区、不同流行期间分离的三株登革1型病毒(DV1)的结构蛋白E基因进行序列测定及分析,了解各流行株之间的遗传差异,追踪其可能的传染来源。方法 应用RT-PCR技术扩增病毒的结构蛋白E基因,克隆到PMD18-T载体,转化JM109宿主菌,挑取阳性克隆进行鉴定及序列测定,应用计算机软件与国内外参考及流行株进行同源性分析,并绘制基因系统发生树。结果 3株DV1病毒E基因序列长度均为1485bp,编码495个氨基酸,核苷酸序列同源性在91%~98%之间,推测的氨基酸序列同源性在94%~99%之间。GD23/95与A88核苷酸(氨基酸)同源性为95%(98%),与其他株的同源性相对较低,2株属同一基因型;GD14/97和GD05/99与Cambodia共享序列非常接近,3株同属另一基因型。结论 广东省1997、1999和1995年流行的登革热可能来自境外不同的疫源地。

关 键 词:登革病毒  包膜蛋白基因  序列分析
文章编号:1000-2588(2005)01-0054-04
修稿时间:2004年1月5日

Analysis of the E gene sequences of three dengue virus type 1 isolates in Guangdong province
TIAN Xiao-dong,LIU Jian-wei,FANG Mei-yu,JIANG Lianhua,REN Rui-wen,HONG Wen-yan,CHENG Gang-feng.Analysis of the E gene sequences of three dengue virus type 1 isolates in Guangdong province[J].Journal of Southern Medical University,2005,25(1):54-57.
Authors:TIAN Xiao-dong  LIU Jian-wei  FANG Mei-yu  JIANG Lianhua  REN Rui-wen  HONG Wen-yan  CHENG Gang-feng
Abstract:
Keywords:dengue virus  E genomic  sequence analysis
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