| 生物信息学分析类风湿性关节炎相关间质性肺病Hub基因及其通路的鉴定 |
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| 引用本文： | 薛菁,马银,韩玉梅,池淑红.生物信息学分析类风湿性关节炎相关间质性肺病Hub基因及其通路的鉴定[J].宁夏医学杂志,2022,44(5):403-406,封3. |
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| 作者姓名： | 薛菁 马银 韩玉梅 池淑红 |
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| 作者单位： | 宁夏大学生命科学学院,宁夏 银川750021;西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室,宁夏 银川750021,宁夏医科大学总医院风湿免疫科,宁夏 银川750004 |
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| 基金项目： | 宁夏自然科学基金项目(2021AAC03369)； |
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| 摘 要： | 目的 明确类风湿性关节炎相关间质性肺病(RA-ILD)发病的潜在分子靶标及通路。方法 NCBI-GEO分别下载类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞(RA-FLS)及间质性肺病(ILD)肺脏组织基因原始表达谱矩阵文件(GSE128813,GSE47460),利用R软件筛选两个数据集的差异表达基因，并获取共同差异表达基因，即目的基因。同时，利用DAVID工具对目的基因进行基因本体论(GO)及通路富集(KEGG)分析。利用STRING数据库和Cyto-scape软件构建目的基因与转录因子(TF)调控网络图并筛选Hub基因。结果 通过对两个基因数据集的差异表达基因(DEGs)取交集获得43个目的基因。GO分析显示，生物学过程主要富集于胶原蛋白分解代谢及间充质细胞增殖等过程；细胞成分组主要富集于细胞外基质等方面；分子功能组主要富集于肝素结合等方面；KEGG通路主要富集于类风湿性关节炎、癌症等通路。蛋白质网络分析筛选出基质金属酶1(MMP1)、基质金属酶3(MMP3)、去整合素金属蛋白酶3(ADAMTS3)、拓扑异构酶2A(TOP2A)等8个关键(Hub)基因。结论 通过生物信息学分析发现的Hub基因及...
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| 关 键 词： | 类风湿性关节炎相关间质性肺病 生物信息学 Hub基因 信号通路 |
Identification of RA-ILD associated Hub genes and their pathways based on bioinformatics analysis |
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| XUE Jing,MA Yin,HAN Yumei,CHI Shuhong.Identification of RA-ILD associated Hub genes and their pathways based on bioinformatics analysis[J].Ningxia Medical Journal,2022,44(5):403-406,封3. |
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| Authors: | XUE Jing MA Yin HAN Yumei CHI Shuhong |
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