大鼠大肠癌模型建立及其基因表达谱初步研究

目的建立实验性大肠癌动物模型,利用基因芯片技术筛选大肠癌发病进程中差异表达基因,探讨大肠癌发生发展过程中可能的信号通路。方法利用二甲肼诱发大鼠大肠癌,收集4例大鼠中的息肉、腺瘤、癌组织及对应正常组织,提取总RNA,应用大鼠全基因组表达谱芯片检测疾病及对应正常组织的基因表达情况,筛选不同组织之间的差异表达基因,以实时荧光定量PCR技术对基因芯片检测结果进行验证,最后利用生物信息技术对差异表达基因进行通路及功能归类。结果获得成功建模大鼠4只。基因芯片结果显示,息肉组织、腺瘤组织及大肠癌组织与正常大肠黏膜组织相比,差异表达基因分别为493、3 472及3 060个。大肠癌序列相关基因在3种病理组织中的表达均发生不同程度的变化。通路分析结果显示,在息肉组织中,细胞因子-细胞因子受体相互作用通路相关基因变化最为显著,P=5.62E-08;在腺瘤组织中,嘌呤代谢通路相关基因变化最为显著,P=7.73E-30;而在大肠癌组织中,核糖体通路相关基因变化最为显著,P=1.40E-27。功能分析结果显示,生物过程功能类归属基因表达变化最多,分子功能类基因其次,而细胞组分类基因最少。RT-PCR验证结果与芯片结果完全相符。结论在成功建立大肠癌动物模型的基础上,通过芯片技术筛选和鉴定了大肠癌疾病发生及发展相关基因,建立了肠息肉、腺瘤及大肠癌组织基因表达谱,为探寻大肠癌早期发病机制及基因靶向治疗提供了分子依据。

Screening the expression profiling of colorectal cancer in DMH-induced Rat