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共调控基因谱挖掘在基因表达数据功能关联分析中的应用
引用本文:李冬果,华琳,郑卫英,闫岩,刘红,张金旺.共调控基因谱挖掘在基因表达数据功能关联分析中的应用[J].中国优生与遗传杂志,2009(11):8-9.
作者姓名:李冬果  华琳  郑卫英  闫岩  刘红  张金旺
作者单位:首都医科大学数学教研室,北京100069
基金项目:本项目为北京市教育委员会科技发展计划面上项目,项目编号为:KM200910025006
摘    要:在基因表达数据中,常采用关联模式发现(APD)方法来识别共调控基因。但这些方法不能发现潜在的隐藏模式。我们提出挖掘共调控基因谱的方法,结果显示这种方法不但可以可以发现隐藏的模式,还可以发现模式中含有的生物学相关信息。此方法优于传统的APD方法和双向聚类法。

关 键 词:基因谱  关联  功能

Mining co-regulation gene patterns to perform function association analysis for gene expression data
Institution:LI Dong - guo , HUA Lin, ZHENGWei - ying, YAN Yan, LIU Hong, ZHANG Jin - wang. ( Department of Mathematics, Capital University of Medical Science, Beijing 100069)
Abstract:Association Pattern Discovery(APD)methods are often used to identify co-regulation genes for gene expression data.However,these methods can not discover those latent hidden patterns.Accordingly,we proposed a method to perform function association analysis by mining co-regulation gene patterns in this paper,which not only can discover those hidden co-regulation patterns but also can discovery many relevant biology information.Our method is prior to traditional APD methods and bicluster methods.
Keywords:Gene patterns  Association  Function
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