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CLCA1在结直肠癌中的表达及其基因集富集分析
引用本文:罗世波,吴江妮,丘新泽,梁志海,刘诗权.CLCA1在结直肠癌中的表达及其基因集富集分析[J].中国临床新医学,2021,14(7):675-679.
作者姓名:罗世波  吴江妮  丘新泽  梁志海  刘诗权
作者单位:530007 南宁,广西医科大学第二附属医院消化内科(罗世波,吴江妮,丘新泽,刘诗权);530021 南宁,广西医科大学第一附属医院消化内科(梁志海)
基金项目:国家自然科学基金项目(编号:81460380);广西自然科学基金项目(编号:2017GXNSFAA198019,2020GXNSFAA159056)
摘    要:[摘要] 目的 探讨钙激活的氯离子通道辅助蛋白1(CLCA1)在结直肠癌(CRC)中的表达及其与临床病理特征和预后的关系,分析其基因集富集情况。方法 通过肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载CLCA1 mRNA表达数据,应用GSEA软件进行CLCA1不同表型的基因集富集分析。分析CLCA1 mRNA在CRC组织与癌旁组织中的差异表达,并分析其与临床病理特征的关联性。采用免疫组织化学染色法分析CLCA1在CRC组织和癌旁组织中的差异。结果 CRC组织中CLCA1表达较癌旁组织明显降低。CRC组织的免疫组织化学染色评分显著低于癌旁组织[(2.46±1.09)分 vs (5.65±0.49)分;t=6.458,P=0.000]。癌旁组织的CLCA1 mRNA表达水平显著高于临床Ⅰ~Ⅱ期CRC组织和临床Ⅲ~Ⅳ期CRC组织(P<0.05),临床Ⅰ~Ⅱ期CRC组织的CLCA1 mRNA表达水平显著高于临床Ⅲ~Ⅳ期CRC组织(P<0.05)。CLCA1高表达组临床分期为Ⅰ~Ⅱ期、N分期为N0期以及M分期为M0期的人数比例显著大于CLCA1低表达组(P<0.05)。CLCA1高表达组的生存预后显著优于CLCA1低表达组(χ2=8.200,P=0.004)。基因集富集分析结果显示,有19个基因集显著富集于CLCA1高表达表型,未发现有基因集显著富集于CLCA1低表达表型。结论 CLCA1在CRC组织中表达下调,并且与患者的临床病理特征及预后有关,具有作为CRC诊断、治疗和预后预测标志物的潜力。

关 键 词:结直肠癌  钙激活的氯离子通道辅助蛋白1  诊断  预后  基因集
收稿时间:2021/4/6 0:00:00

Expression of CLCA1 in colorectal cancer and its gene set enrichment analysis
LUO Shi-bo,WU Jiang-ni,QIU Xin-ze,et al..Expression of CLCA1 in colorectal cancer and its gene set enrichment analysis[J].Chinese Journal of New Clinical Medicine,2021,14(7):675-679.
Authors:LUO Shi-bo  WU Jiang-ni  QIU Xin-ze  
Institution:Department of Gastroenterology, the Second Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530007, China
Abstract:
Keywords:
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