利用生物信息学分析人ZUP1基因在乳腺癌中的表达及机制 |
| |
作者姓名: | 张光君 涂刚 |
| |
作者单位: | 重庆医科大学附属第一医院内分泌乳腺外科,重庆医科大学附属第一医院内分泌乳腺外科 |
| |
摘 要: | 目的 探讨ZUP1在乳腺癌(BC)发生发展中的临床价值及上下游机制。方法 通过使用GEO,TCGA和GTEx数据库,探索ZUP1在乳腺癌中表达水平与临床应用价值。利用单因素回归分析乳腺癌患者数据库临床信息,比较乳腺癌组织中ZUP1 表达与临床病理因素的关系。将乳腺癌患者分为ZUP1高表达组和ZUP1低表达组,使用Kaplan-Meier分析乳腺癌患者生存状况。用生物信息学方法预测潜在调控ZUP1的miRNA和泛素连接酶,最后进行基因集富集分析。结果 以GEO数据库为基础的ZUP1在乳腺癌组织中的表达高于正常对照组织。ZUP1高表达组患者的预后显著低于低表达组(P=0.031)。Hsa-miR-10b-3p和hsa-miR-499a-5p表达水平与ZUP1表达呈负相关,包括MARCH1,MARCH8,Mdm2,synoviolin和MIB1在内的E3泛素化蛋白连接酶可能调节ZUP1的蛋白表达。GSEA结果说明ZUP1主要在乳腺癌中参与“基础转录因子”, “泛素介导的蛋白质水解”, “卵母细胞减数分裂”, “RNA降解”和 “极光B通路”等通路。结论ZUP1在乳腺癌中表达上调,与病人预后具有相关性,可能是一种具有前瞻性的诊断和预后的乳腺癌生物标志物。
|
关 键 词: | ZUP1 乳腺癌 生存分析 生物标志物 生物信息学 |
收稿时间: | 2020/8/30 0:00:00 |
修稿时间: | 2020/12/24 0:00:00 |
Expression and mechanisms of ZUP1 in breast cancer: a bioinformatics analysis |
| |
Authors: | ZHANG Guang-jun TU Gang |
| |
Institution: | Department of Endocrine and Breast Surgery,First Affiliated Hospital of CHongqing Medical University,Chongqing,Department of Endocrine and Breast Surgery,First Affiliated Hospital of CHongqing Medical University,Chongqing |
| |
Abstract: | |
| |
Keywords: | ZUP1 breast cancer survival rate biomarker bioinformatics |
|
| 点击此处可从《》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《》下载免费的PDF全文 |
|