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基于m7G相关lncRNA识别胃癌的预后及免疫特征
作者姓名:王振  张乐  刘虹汝  张钰哲
作者单位:1. 大理大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室;2. 云南抗病原药用植物筛选重点实验室;3. 云南省昆虫生物医药重点实验室
基金项目:云南省教育厅科学研究基金项目(2023Y0950,2022Y80);
摘    要:目的 探讨N7-甲基鸟苷(m7G)修饰相关长链非编码RNA (lncRNA)与胃癌的预后及免疫特征间的关系。方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取胃癌和癌旁组织的转录组数据和临床数据。采用皮尔森相关分析识别m7G相关的lncRNA。通过单因素Cox回归、最小绝对收缩和运算符选择(LASSO)回归算法和多因素Cox回归构建m7G相关lncRNA的风险预测模型,并通过Kaplan-Meier生存曲线和受试者操作特征(ROC)曲线验证。构建列线图用于预测胃癌患者的预后。通过基因本体(GO)、京都基因和基因组数据库(KEGG)和免疫功能分析m7G高、低风险组生物功能的差异。通过肿瘤免疫逃逸(TIE)、免疫治疗药物敏感性和肿瘤突变负荷(TMB)评估免疫治疗反应。结果 由6个m7G相关lncRNA (AC090425.3,AC004817.3,AC023590.1,C3orf36,AC012055.1,LINC01854)构建的预后模型被证明具有良好的预测能力。GO和KEGG富集分析表明,肌肉相关生物学...

关 键 词:胃癌  N7-甲基鸟苷  长链非编码RNA  预后  肿瘤突变负荷  免疫检查点阻断
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