ddPCR与 ARMS-PCR检 测 NSCLC患者EGFR基因T790M突变的比较研究 |
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作者姓名: | 李月 徐玉霞 |
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作者单位: | 中山大学肿瘤防治中心 |
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摘 要: | 目的:通过对比微滴式数字 PCR(dropletdigitalPCR,ddPCR)和突变扩增阻滞系统 PCR(amplificationrefrac torymutationsystemPCR,ARMS PCR)检测非小细胞肺癌(non smallcelllungcancer,NSCLC)表皮生长因子受体(epi dermalgrowthfactorreceptor,EGFR)基因 T790M突变的检测效能,综合分析两种检测方法的优势及适用范围。方法: 回顾性收集 115例 NSCLC患者的标本,同时使用 ddPCR和 ARMS PCR两种方法检测 EGFR基因 T790M突变状态, 比较两种方法的检测结果,并分析不同样本类型对 ddPCR检测结果的影响。结果:ddPCR检测 T790M阳性率为 65.2%,ARMS PCR阳性率为 27.8%,ddPCR检测敏感性显著高于 ARMS PCR(P<0.05),两种方法检测一致率为 62.6%。ddPCR+ARMS-样本的 T790M平均阳性微滴数和平均突变丰度(11,0.35%)均显著低于 ddPCR+ARMS +样本(632.3,17.7%)。ddPCR检测基因组 DNA和外周血游离 DNA阳性率分别为 55.9%和 78.7%,不同样本类 型 T790M突变阳性微滴数和突变丰度无显著差别。结论:ddPCR和 ARMS PCR均可用于 NSCLC患者 EGFR基因 T790M突变检测,二者具有良好的一致性,ddPCR具有更高的灵敏性,在检测突变丰度较低的样本方面具有优势。
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关 键 词: | EGFR基因 T790M突变 ddPCR ARMS-PCR 非小细胞肺癌 |
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