| miR-223基因家族的分子进化与靶基因预测 |
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| 引用本文： | 钟晓武,青玉凤,杨其彬,何泳龙,赵明才,谢文光,周京国.miR-223基因家族的分子进化与靶基因预测[J].川北医学院学报,2016,31(3):315-320. |
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| 作者姓名： | 钟晓武 青玉凤 杨其彬 何泳龙 赵明才 谢文光 周京国 |
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| 作者单位： | 川北医学院附属医院 1.检验科;医学研究中心，四川 南充 637000;风湿免疫科;川北医学院附属医院 1.检验科 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81272047)；四川省教育厅科研项目(15 ZB0197)；南充市科技支撑项目(14A0061)；川北医学院科研发展计划博士科研启动基金(CBY14-QD-07，CBY13-QD-03) |
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| 摘 要： | 目的:分析所有miR-223基因家族成员的序列特征,并对miR-223靶基因进行预测,然后分析miR-223靶基因的生物学功能。方法:利用Clustal X 1.83软件分析miR-223基因序列特征,MEGA 5.0软件分析进化关系,再运用TargetScan、PicTar和miRDB进行靶基因预测,最后GO和KEGG进行功能分析。结果:在miRBase数据中获得miRNA-223基因家族成员的序列27条,绝大部分位于基因间隔区,少数成员的基因位置未知。大部分定位于X染色体,部分成员位于常染色体。miRNA-223成熟序列长度在20-23nt之间,同源性较高。系统进化树分析表明,miRNA-223基因家族成员分为三支。预测获得人类miRNA-223的可能具有27个靶基因,它们主要与信号转导、转录调控以及细胞生长发育等密切相关。结论:本研究结果不仅有利于理解miR-223基因家族的生物学功能,也可为后续研究提供理论依据。
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| 关 键 词： | miRNA-223 分子进化 靶基因 功能分析 |
Molecular evolution of miR-223 gene family and prediction of their target genes |
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| ZHONG Xiao-wu,QING Yu-feng,YANG Qi-bin,HE Yong-long,ZHAO Ming-cai,XIE Wen-guang,ZHOU Jing-guo.Molecular evolution of miR-223 gene family and prediction of their target genes[J].Journal of North Sichuan Medical College,2016,31(3):315-320. |
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| Authors: | ZHONG Xiao-wu QING Yu-feng YANG Qi-bin HE Yong-long ZHAO Ming-cai XIE Wen-guang ZHOU Jing-guo |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | miRNA-223 Molecular Evolution Target Genes Functional analysis |
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