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小鼠Reelin 基因启动子克隆鉴定及生物信息学分析
引用本文:张建军,姜树原,张颜波,吴松泉,牛敬忠,邵国.小鼠Reelin 基因启动子克隆鉴定及生物信息学分析[J].泰山医学院学报,2012,33(7):484-487.
作者姓名:张建军  姜树原  张颜波  吴松泉  牛敬忠  邵国
作者单位:张建军 (鄂尔多斯市康巴什新区医疗急救中心,内蒙古,鄂尔多斯,017000) ; 姜树原 (包头医学院生物医学研究中心,内蒙古,包头,014010) ; 张颜波 (包头医学院基础医学院,内蒙古,包头,014010) ; 吴松泉 (泰山医学院附属医院神经内科,山东,泰安,271000) ; 牛敬忠 (丽水学院医学院,浙江,丽水,323000) ; 邵国 (泰山医学院附属医院神经内科,山东,泰安,271000) ;
基金项目:国家自然科学基金,中国博士后基金,内蒙古自然科学基金,山东省自然科学基金,内蒙古自治区高等学校科研项目
摘    要:目的克隆小鼠Reelin基因启动子区并分析其潜在DNA甲基化位点和转录因子结合位点。方法根据NCBI上小鼠Reelin 5’非翻译区序列设计引物,利用高保真PCR方法克隆昆明小鼠Reelin启动子区序列,并进行TA克隆,测序鉴定。利用亚硫酸氢钠处理基因组DNA,通过PCR技术和测序技术对Reelin启动子-636 bp至-135bp序列甲基化情况分析。应用Methyl Primer Express software V1.0和TFSEARCH软件分析该区域甲基化位点和转录因子结合位点。结果成功克隆了小鼠Reelin基因启动子区0至-450片段。甲基化测序分析小鼠Reelin启动子区-636 bp至-135 bp序列没有CpG二核苷酸被甲基化。小鼠Reelin翻译起始点0至-450片段利用CpG岛序列分析软件分析显示,该区域C+G含量高达78.71%,CpG含量为14.44%。该区域有120多个潜在转录因子结合位点。结论在小鼠Reelin基因启动子区0~-450发现有一个CpG岛和多个转录因子结合位点,该区域可能在小鼠Reelin基因表达调控起重要作用。

关 键 词:Reelin  启动子  生物信息学  DNA甲基化

Cloning and bioinformations analysis of promoter sequences of mice Reelin
ZHANG Jian-jun,JIANG Shu-yuan,ZHANG Yan-bo,WU Song-quan,NIU Jing-zhong,SHAO Guo.Cloning and bioinformations analysis of promoter sequences of mice Reelin[J].Journal of Taishan Medical College,2012,33(7):484-487.
Authors:ZHANG Jian-jun  JIANG Shu-yuan  ZHANG Yan-bo  WU Song-quan  NIU Jing-zhong  SHAO Guo
Institution:2,3(1.Emergency Department,Kangbashi Hosipital,Erduosi 017000,China;2.Biomedicine Research Center,Baotou Medical College, 3.Dept.of Basic Medicine,Baotou Medical College,BaoTou 014010,China;4.Dept.of Neurology,Affiliated Hospital of Taishan Medical College,Taian 271000,China;5.Medical School,Lishui University,Lishui 323000,China)
Abstract:
Keywords:Reelin  promoter  bioinformation  DNA methylation
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