三株登革2型病毒广东分离株结构蛋白E基因序列测定及分析 |
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引用本文: | 方美玉,任瑞文,洪文艳,蒋廉华,刘建伟,田小东,林立辉.三株登革2型病毒广东分离株结构蛋白E基因序列测定及分析[J].中华流行病学杂志,2002,23(Z1):111-113. |
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作者姓名: | 方美玉 任瑞文 洪文艳 蒋廉华 刘建伟 田小东 林立辉 |
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作者单位: | 510507,广州军区军事医学研究所 |
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基金项目: | 全军医学科研"十五"计划重大课题资助项目(012014) |
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摘 要: | 目的对广东省分离的3株登革2型病毒(DEN2)的结构蛋白E基因扩增、克隆、测定及分析,了解流行株之间的相互关系及基因型.方法应用RT-PCR技术扩增广东省不同年份流行的3株DEN2型病毒的结构蛋白E基因.分别克隆到PMD18 T载体,转化JM109宿主菌,挑取阳性克隆进行鉴定及序列测定.结果3株DEN2病毒结构蛋白E基因序列长度均为1 485 bp,编码495个氨基酸.其核苷酸(氨基酸)的同源性分别是GD06/93与GD19/2001为98%(98%)、GD06/93与GD08/98为92%(95%)、GD08/98与GD19/2001为91%(94%).3株DEN2与国际参考株比较表明GD06/93与澳大利亚TSV01株共享序列非常接近,核苷酸(氨基酸)的同源性为99%(99%);GD19/2001和澳大利亚TSV01株核苷酸(氨基酸)的同源性为98%(98%);GD08/98与泰国株ThNH-P28/93核苷酸(氨基酸)同源性为98%(98%).结论GD06/93、GD19/2001与TSV01亲缘关系较近,属同一基因型.GD08/98与TnNH-P28/93共享序列非常接近,属同一基因型.
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关 键 词: | 登革病毒 结构基因 序列分析 |
修稿时间: | 2002年7月3日 |
Sequencing and structural analysis of E gene of three dengue virus type 2 isolated from Guangdong province |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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