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湖北地区季节性H1N1流感病毒NA和M基因特性分析
引用本文:李静,方斌,刘琳琳,叶国军,邓渠,霍细香.湖北地区季节性H1N1流感病毒NA和M基因特性分析[J].中国病原生物学杂志,2012(6):418-421,425.
作者姓名:李静  方斌  刘琳琳  叶国军  邓渠  霍细香
作者单位:湖北省疾病预防控制中心
基金项目:湖北省卫生厅重点科研课题(No.JX3B41)
摘    要:目的分析湖北省2000年以来甲型流感病毒株神经氨酸酶(NA)和M基因特性,以及耐药性位点的变异情况。方法从2000~2008年临床样品中分离毒株,运用RT-PCR扩增NA和M基因,对扩增片段进行序列测定,利用DNAStar软件与世界卫生组织推荐的流感疫苗毒株进行同源性比较,对NA和M基因重要功能性位点和耐药性位点进行分析,利用Mega软件进化分析。结果2000~2008年临床样品流感病毒分离株的NA和M基因与同年疫苗株相应基因的同源性分别为96.6%~99.7%和96.6%~99.6%,分离株NA基因中潜在的抗原性位点和糖基化位点与2000~2008年疫苗株基本相同,与2009年疫苗株有一定差异。NA基因未发生耐药性突变,但M基因在2005年以后的分离株中发生了S→N突变。NA和M基因进化分析表明不同年份分离株呈现出不同的亲缘关系。结论湖北省季节性甲型H1N1流感病毒分离株与2000~2008年世界卫生组织推荐的疫苗毒株有高度同源性,但与2009年疫苗株有所不同,未出现达菲类药物抗药性位点的核苷酸突变,但2005年后的分离株在M基因上均发生金刚烷胺类耐药性突变。NA和M基因进化树中可以看到甲型H1N1流感病毒进化关系在时间(年)上具有聚集性。

关 键 词:甲型流感病毒  疫苗株  神经氨酸酶  基质蛋白  分子特征和进化

Genetic characteristics and drug resisitance amino acids sites of NA and M genes of influenza A/H1N1 virus in Hubei Province
LI Jing,FANG Bin,LIU Lin-lin,YE Guo-jun,DENG Qu,HUO Xi-xiang.Genetic characteristics and drug resisitance amino acids sites of NA and M genes of influenza A/H1N1 virus in Hubei Province[J].Journal of Pathogen Biology,2012(6):418-421,425.
Authors:LI Jing  FANG Bin  LIU Lin-lin  YE Guo-jun  DENG Qu  HUO Xi-xiang
Institution:(Hubei Center for Disease Control and Prevention,Wuhan 430079,China)
Abstract:
Keywords:
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