Muse干细胞对脂多糖干预的髓核细胞基因表达差异的影响题录 |
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引用本文: | 张磊,冷子宽,燕淼恒,宋宗冕,陈松峰,毛克亚,刘宏建.Muse干细胞对脂多糖干预的髓核细胞基因表达差异的影响题录[J].中华实验外科杂志,2024(1). |
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作者姓名: | 张磊 冷子宽 燕淼恒 宋宗冕 陈松峰 毛克亚 刘宏建 |
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作者单位: | 1. 郑州大学第一附属医院骨科医学部;2. 解放军总医院骨科医学部 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(82372472、82101451、82172484);;河南省医学科技攻关计划(LHGJ20190171); |
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摘 要: | 目的探讨Muse干细胞对脂多糖(LPS)诱导的髓核细胞(NPCs)转录组基因表达差异的影响。方法采用胰酶消化方法从人脐带间充质干细胞中获取Muse干细胞, LPS刺激大鼠原代NPCs诱导其凋亡及炎症, 以模拟椎间盘退变微环境。使用Muse干细胞与间充质干细胞与LPS刺激后的髓核细胞共培养24 h。通过细胞免疫荧光检测SSEA-3和CD105来鉴定Muse干细胞, 通过细胞免疫荧光检测二型胶原蛋白(Collagen Ⅱ)和聚集蛋白聚糖(Aggrecan)来鉴定大鼠原代NPCs。取未处理的髓核细胞, LPS刺激后的髓核细胞, 以及Muse干细胞与间充质干细胞共培养NPCs各3个样本进行提取组织总RNA, 后进行转录组测序。对测序获得的基因表达数据, 使用R软件中的DESeq2包进行差异分析, 采用生物信息学方法筛选出差异表达基因。对差异表达基因进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析, 筛选在椎间盘退变(IDD)进展中Muse干细胞可能起作用的相关基因。结果与未处理的髓核细胞比较, LPS刺激后的NPCs有1 560个上调差异表达基因(DEGs)和2 173个下...
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关 键 词: | Muse干细胞 髓核细胞 转录组测序 细胞凋亡 |
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