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HIV-1 B’亚型感染者Nef蛋白CTL表位变异与病毒载量的相关性
引用本文:胡园园,陈燕丽,张岱,邹森,侯佳莉,任莉,郝彦玲. HIV-1 B’亚型感染者Nef蛋白CTL表位变异与病毒载量的相关性[J]. 中国热带医学, 2016, 0(11): 1070-1073. DOI: 10.13604/j.cnki.46-1064/r.2016.11.05
作者姓名:胡园园  陈燕丽  张岱  邹森  侯佳莉  任莉  郝彦玲
作者单位:中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,传染病预防控制国家重点实验室,北京102206
基金项目:国家自然科学基金(No.81172809)
摘    要:目的探讨HIV-1 B’亚型毒株感染者Nef蛋白细胞毒性淋巴细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位变异及其与病毒载量的相关性。方法从137例HIV-1 B’亚型毒株感染者的血浆样本中提取病毒RNA,经逆转录及巢式PCR扩增获得Nef基因并测序,将获得的Nef基因序列翻译为蛋白序列,然后与HIV免疫学数据库中经过实验证实的CTL表位进行比对,分析Nef蛋白CTL表位变异与感染者病毒载量的关系。结果与HIV免疫学数据库中CTL表位的比较发现,本研究137例HIV-1 B’亚型毒株感染者病毒Nef蛋白大部分CTL表位相对保守,只有5个表位的变异频率超过10%,CTL表位旁序列的变异程度较锚着位点变异大,表位旁上下游第一位氨基酸的突变频率较高,表位氨基酸总变异频率、锚着位点和表位旁序列的氨基酸变异频率与病毒载量呈正相关,非锚着位点氨基酸的变异与病毒载量无相关性。结论 HIV-1 B’亚型毒株感染者Nef蛋白大部分CTL表位较保守,CTL表位旁序列变异程度较锚着位点大,表位旁上下游第一位氨基酸的突变频率较高,推测表位旁序列氨基酸的变异可能是Nef蛋白CTL逃逸突变的主要方式,Nef蛋白CTL表位变异与病毒适应性损伤的关系还需进一步研究。

关 键 词:HIV-1  Nef蛋白  CTL表位  病毒载量

Association between CTL epitope variations of Nef protein and viral loads in HIV-1 B'infectors
Abstract:
Keywords:HIV-1  Nef protein  CTL epitopes  viral load
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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