HIV-1 B’亚型感染者Nef蛋白CTL表位变异与病毒载量的相关性 |
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引用本文: | 胡园园,陈燕丽,张岱,邹森,侯佳莉,任莉,郝彦玲. HIV-1 B’亚型感染者Nef蛋白CTL表位变异与病毒载量的相关性[J]. 中国热带医学, 2016, 0(11): 1070-1073. DOI: 10.13604/j.cnki.46-1064/r.2016.11.05 |
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作者姓名: | 胡园园 陈燕丽 张岱 邹森 侯佳莉 任莉 郝彦玲 |
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作者单位: | 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,传染病预防控制国家重点实验室,北京102206 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(No.81172809) |
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摘 要: | 目的探讨HIV-1 B’亚型毒株感染者Nef蛋白细胞毒性淋巴细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位变异及其与病毒载量的相关性。方法从137例HIV-1 B’亚型毒株感染者的血浆样本中提取病毒RNA,经逆转录及巢式PCR扩增获得Nef基因并测序,将获得的Nef基因序列翻译为蛋白序列,然后与HIV免疫学数据库中经过实验证实的CTL表位进行比对,分析Nef蛋白CTL表位变异与感染者病毒载量的关系。结果与HIV免疫学数据库中CTL表位的比较发现,本研究137例HIV-1 B’亚型毒株感染者病毒Nef蛋白大部分CTL表位相对保守,只有5个表位的变异频率超过10%,CTL表位旁序列的变异程度较锚着位点变异大,表位旁上下游第一位氨基酸的突变频率较高,表位氨基酸总变异频率、锚着位点和表位旁序列的氨基酸变异频率与病毒载量呈正相关,非锚着位点氨基酸的变异与病毒载量无相关性。结论 HIV-1 B’亚型毒株感染者Nef蛋白大部分CTL表位较保守,CTL表位旁序列变异程度较锚着位点大,表位旁上下游第一位氨基酸的突变频率较高,推测表位旁序列氨基酸的变异可能是Nef蛋白CTL逃逸突变的主要方式,Nef蛋白CTL表位变异与病毒适应性损伤的关系还需进一步研究。
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关 键 词: | HIV-1 Nef蛋白 CTL表位 病毒载量 |
Association between CTL epitope variations of Nef protein and viral loads in HIV-1 B'infectors |
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Abstract: | |
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Keywords: | HIV-1 Nef protein CTL epitopes viral load |
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