| 猪戊型肝炎病毒株swGX32全基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 吉彦莉,李凌君,韦献飞,王玲,常义斌,唐荣兰,朱永红,庄辉. 猪戊型肝炎病毒株swGX32全基因组序列分析[J]. 中华微生物学和免疫学杂志, 2008, 28(5) |
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| 作者姓名： | 吉彦莉 李凌君 韦献飞 王玲 常义斌 唐荣兰 朱永红 庄辉 |
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| 作者单位： | 1. 北京大学医学部病原生物学系,100083
2. 广西柳州高等卫生学校 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，国家高技术研究发展计划(863计划)，广西自然科学基金 |
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| 摘 要： | 目的 分析从广西地区分离的1株猪戊型肝炎病毒swGX32全基因组序列并比较其与其他分离株的差异.方法 设计PCR引物,用巢式反转录聚合酶链反应法(RT-nPCR)分段扩增戊型肝炎病毒(HEV)株swGX32全基因序列,用cDNA末端快速扩增法(RACE)扩增其末端序列,对扩增产物进行克隆和测序,并对拼接后的基因组进行序列和进化分析.结果 除3′polyA尾巴外,swGX32全长7240 nt, ORF1与ORF2重叠4 nt, ORF3包含在ORF2序列中.swGX32全基因序列与HEV1～4型核苷酸序列的同源性分别为:73%～74%、73%、74%～75%,83%～94%,其中与中国人源HEV株JKO-ChiSai98C同源性最高,达94%.全基因序列进化分析显示,swGX32位于HEV基因4型分枝上,ORF2部分核苷酸序列进化分析显示,swGX32与JKO-ChiSai98C同在HEV 4a亚型分枝上.结论 猪HEV swGX32在全基因组结构及分子进化上均与人HEV JKO-ChiSai98C有密切关系,为揭示戊型肝炎是一种人兽共患病提供了分子生物学依据.
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| 关 键 词： | 戊型肝炎病毒 猪 基因型 人畜共患病 |
The analysis of the complete genome sequence of swine hepatitis E virus isolate swGX32 |
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| JI Yan-li,LI Ling-jun,WEI Xian-fei,WANG Ling,CHANG Yi-bin,TANG Rong-lan,ZHU Yong-hong,ZHUANG Hui. The analysis of the complete genome sequence of swine hepatitis E virus isolate swGX32[J]. Chinese Journal of Microbiology and Immunology, 2008, 28(5) |
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| Authors: | JI Yan-li LI Ling-jun WEI Xian-fei WANG Ling CHANG Yi-bin TANG Rong-lan ZHU Yong-hong ZHUANG Hui |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hepatitis E virus Swine Genotype Zoonosis |
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