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miR-542-3p对骨肉瘤细胞侵袭能力的影响以及靶基因预测
引用本文:林希圣,郑超,杨柳,罗卓荆.miR-542-3p对骨肉瘤细胞侵袭能力的影响以及靶基因预测[J].骨科,2018,9(1).
作者姓名:林希圣  郑超  杨柳  罗卓荆
作者单位:第四军医大学西京医院骨科,第四军医大学西京医院骨科,第四军医大学西京医院骨科,第四军医大学西京医院骨科
基金项目:国家自然科学基金重点项目(编号:81730065)
摘    要:【】目的 明确miR-542-3p抑制骨肉瘤细胞系HOS以及SAOS2细胞侵袭能力,建立生物信息学miR-542-3p靶基因调控网络,并探讨其潜在作用靶点。方法 使用miR-542-3p mimics 转染HOS以及SAOS2细胞,进行Transwell小室细胞侵袭能力测定。利用基因表达共享数据库GEO联合GEO2R平台,获取并分析miRNA-542-3p与miR-neg转染的U2OS细胞的基因表达谱数据及差异表达基因,进而使用miRNA预测数据库及Cytoscape软件,预测并建立miR-542-3p靶基因调控网络。qPCR验证mir-542-3p转染HOS以及SAOS2细胞后,部分预测目标靶基因的mRNA表达水平变化。结果 mir-542-3p 转染组骨肉瘤细胞的侵袭能力较对照组明显降低(P<0.05)。数据库差异基因分析表明,miRNA-542-3p与miR-neg转染的U2OS细胞的表达差异基因共417个,其中185个基因表达下调。实时定量PCR结果显示,Targetsacn以及MiRanda数据库预测靶基因中,miR-542-3p转染细胞组的ILK, TBPL1和ETS1表达水平显著低于对照组(P<0.05)。结论 miR-542-3p通过下调ILK, TBPL1以及ETS1显著抑制骨肉瘤细胞的侵袭能力。

关 键 词:骨肉瘤  侵袭  微小RNA
收稿时间:2017/11/6 0:00:00
修稿时间:2017/11/6 0:00:00

Effect of miR-542-3p on invasion of osteosarcoma cells and its target genes prediction.
LIN Xisheng,ZHENG Chao,YANG Liu and LUO Zhuojing.Effect of miR-542-3p on invasion of osteosarcoma cells and its target genes prediction.[J].Orthopaedics,2018,9(1).
Authors:LIN Xisheng  ZHENG Chao  YANG Liu and LUO Zhuojing
Institution:Institute of Orthopedics , Xijing Hospital of The Fourth Military Medical University,Institute of Orthopedics , Xijing Hospital of The Fourth Military Medical University Institute of Orthopedics , Xijing Hospital of The Fourth Military Medical University,Institute of Orthopedics , Xijing Hospital of The Fourth Military Medical University,Institute of Orthopedics , Xijing Hospital of The Fourth Military Medical University
Abstract:
Keywords:Osteosarcoma  Invasion  miRNA
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