首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
检索        

盾叶薯蓣须根响应低磷胁迫的GC-MS代谢产物及基因表达特征分析
引用本文:谢彩侠,崔锦鹏,李雅静,张娟,刘庆普,龚海燕,雷敬卫,王丰青.盾叶薯蓣须根响应低磷胁迫的GC-MS代谢产物及基因表达特征分析[J].中国实验方剂学杂志,2022,28(13):189-197.
作者姓名:谢彩侠  崔锦鹏  李雅静  张娟  刘庆普  龚海燕  雷敬卫  王丰青
作者单位:1.河南中医药大学 药学院,河南省中药质量控制与评价工程技术研究中心,郑州 450046;2.河南农业大学,郑州 450032
基金项目:河南省高等学校重点科研项目(20A360016)
摘    要:目的 探讨盾叶薯蓣须根在低磷胁迫下的代谢产物及基因表达特征。方法 设置重度胁迫组、中度胁迫组与正常组模拟盾叶薯蓣低磷胁迫实验,在胁迫初期采取盾叶薯蓣须根,分别利用气相色谱-质谱联用技术(GC-MS)衍生化及RNA-seq技术对其代谢产物和转录组特征进行分析,通过对不同处理代谢产物的多元统计分析、差异表达基因的功能分析及数据挖掘,筛选低磷胁迫下盾叶薯蓣须根产生的代谢标志物,分析差异表达基因的代谢通路特征。结果 从盾叶薯蓣须根中共检测到116个GC-MS代谢产物,不同低磷处理下盾叶薯蓣须根的代谢特征存在明显差异,利用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)模型从不同处理须根的代谢产物中筛选到6个差异代谢物,主要为糖类、醇类等成分,这些物质可能是盾叶薯蓣须根响应低磷胁迫的代谢标志物;重度胁迫组与正常组中筛选到的差异基因主要富集到过氧化物酶途径、磷酸盐和次磷酸盐代谢途径,重度胁迫组与中度胁迫组中筛选到的差异基因主要富集到谷胱甘肽代谢途径及磷酸戊糖途径;从须根中筛选出177个潜在响应低磷胁迫的差异基因,涉及萜类骨架、肌醇生物合成等多个途径,这与盾叶薯蓣须根部位响应低磷胁迫的代谢差异物多为糖类与肌醇等物质相吻合。结论 低磷胁迫下盾叶薯蓣须根部位的代谢产物及基因表达均发生了相应的应答,差异代谢物与差异表达基因具有密切的关系,该研究为盾叶薯蓣响应低磷胁迫的分子机制提供理论依据。

关 键 词:盾叶薯蓣  低磷胁迫  气相色谱-质谱联用技术(GC-MS)  RNA-seq  差异代谢物  差异基因
收稿时间:2021/12/14 0:00:00

GC-MS Metabolites and Gene Expression Characteristics in Fibrous Roots of Dioscorea zingiberensis in Response to Low Phosphorus Stress
XIE Caixi,CUI Jinpeng,LI Yajing,ZHANG Juan,LIU Qingpu,GONG Haiyan,LEI Jingwei,WANG Fengqing.GC-MS Metabolites and Gene Expression Characteristics in Fibrous Roots of Dioscorea zingiberensis in Response to Low Phosphorus Stress[J].China Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2022,28(13):189-197.
Authors:XIE Caixi  CUI Jinpeng  LI Yajing  ZHANG Juan  LIU Qingpu  GONG Haiyan  LEI Jingwei  WANG Fengqing
Abstract:
Keywords:
点击此处可从《中国实验方剂学杂志》浏览原始摘要信息
点击此处可从《中国实验方剂学杂志》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号