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基于ITS2和psbA-trnH条形码的藏党参的分子鉴定
引用本文:李凤超,李惠敏,尹显梅,高必兴,连艳,蒋桂华.基于ITS2和psbA-trnH条形码的藏党参的分子鉴定[J].中国实验方剂学杂志,2022,28(13):173-180.
作者姓名:李凤超  李惠敏  尹显梅  高必兴  连艳  蒋桂华
作者单位:1.成都中医药大学 药学院 西南特色中药资源国家重点实验室, 中药材标准化重点实验室,成都 611137;2.四川省药品检验研究院,国家药品监督管理局中成药质量评价重点实验室,成都 611731;3.成都中医药大学 民族医药学院,成都 611137
基金项目:国家自然科学基金项目(82173928);国家重点研发计划项目(2019YFC1712302,2019YFC1712305);四川省科技厅应用基础项目(2020YJ0369)
摘    要:目的 应用内转录间隔区(ITS)2及psbA-trnH条形码技术,对藏党参各物种之间进行分子生物学鉴定。方法 通过提取4个物种(灰毛党参Codonopsis canescens、脉花党参C. foetens subsp. nervosa、党参C. pilosula、长花党参C. thalictrifolia var. mollis)28份藏党参样品的基因组DNA,扩增ITS2及psbA-trnH序列并测序,并结合GenBank下载藏党参相关序列81条,包括15个物种,采用MEGA 6.0软件进行比对、变异位点分析、计算GC含量及种内和种间遗传距离,最大似然法(ML)、邻接法(NJ)、非加权组平均法(UPGMA)3种方法进行系统发育树的构建。结果 根据变异位点能将灰毛党参C. canescens、党参(党参C. pilosula、川党参C. pilosula subsp. tangshen及素花党参C. pilosula var. modesta)、西藏党参C. bhutanica、新疆党参C. clematidea、羊乳C. lanceolata、球花党参C. subglobosa及臭党参C. foetens区分;在系统发育树中,ITS2序列以ML法的聚类效果最佳,psbA-trnH序列以UPGMA法的聚类效果最佳,能对12个物种进行有效聚类区分。结论 ITS2及psbA-trnH条形码对单基原物种的鉴定率较高,但对变种与原变种间的鉴定仍存在一定局限性,这为后续藏党参物种之间的亲缘关系鉴定和临床应用等提供参考。

关 键 词:党参  DNA条形码  内转录间隔区(ITS)2序列  psbA-trnH序列  分子鉴定
收稿时间:2021/12/31 0:00:00

Molecular Identification of Tibetan Codonopsis Plants Based on ITS2 and psbA-trnH Barcode
LI Fengchao,LI Huimin,YIN Xianmei,GAO Bixing,LIAN Yan,JIANG Guihua.Molecular Identification of Tibetan Codonopsis Plants Based on ITS2 and psbA-trnH Barcode[J].China Journal of Experimental Traditional Medical Formulae,2022,28(13):173-180.
Authors:LI Fengchao  LI Huimin  YIN Xianmei  GAO Bixing  LIAN Yan  JIANG Guihua
Abstract:
Keywords:
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