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胃癌细胞中高表达hnRNP K蛋白上调miR-20a的表达
引用本文:方海云1,' target='_blank'>2,郭佳慧1,高丰厚1. 胃癌细胞中高表达hnRNP K蛋白上调miR-20a的表达[J]. 现代肿瘤医学, 2020, 0(5): 706-712. DOI: 10.3969/j.issn.1672-4992.2020.05.004
作者姓名:方海云1  ' target='_blank'>2  郭佳慧1  高丰厚1
作者单位:1.上海交通大学医学院附属第九人民医院肿瘤科,上海 201900;2.上海交通大学医学院附属新华医学(崇明)检验科,上海 202150
基金项目:National Natural Science Foundation of China(No.81172322);国家自然科学基金(编号:81172322)
摘    要:目的:探索胃癌细胞中高表达hnRNP K蛋白直接调控的miRNA。方法:通过制备正常胃黏膜细胞GES-1和胃癌细胞SGC-7901的细胞芯片初筛高表达hnRNP K胃癌细胞miRNA表达谱;查询TCGA数据库得到胃癌大样本mRNA转录组和miRNA数据,分析处理得到hnRNP K以2倍差异高表达对应的miRNA差异表达谱;对芯片和TCGA数据库结果交互分析得到上调共表达的miRNA;过表达和敲除hnRNP K,通过Western Blot和Real Time q-PCR验证筛查的结果;利用TCGA大数据对hnRNP K和miRNA进行归一化处理,验证筛选的miRNA与hnRNP K和胃癌的相关性。结果:通过芯片初筛miRNA表达谱与TCGA查询结果交互分析得到胃癌上调miRNA共表达谱(miR-17/20a/24/182);Western Blot和Real Time q-PCR验证结果显示hnRNP K可直接调控miR-20a的表达;TCGA数据分析表明miR-20a与hnRNP K正相关,且在胃癌中高表达。结论:胃癌细胞中高表达hnRNP K蛋白上调miR-20a的表达。

关 键 词:胃癌  hnRNP K蛋白  miRNA  芯片  TCGA数据库  miR-20a

High expression of hnRNP K protein in gastric cancer cells regulates the expression of miR-20a
Fang Haiyun1,' target='_blank'>2,Guo Jiahui1,Gao Fenghou1. High expression of hnRNP K protein in gastric cancer cells regulates the expression of miR-20a[J]. Journal of Modern Oncology, 2020, 0(5): 706-712. DOI: 10.3969/j.issn.1672-4992.2020.05.004
Authors:Fang Haiyun1  ' target='_blank'>2  Guo Jiahui1  Gao Fenghou1
Affiliation:1.Department of Oncology,Shanghai Ninth People's Hospital,Shanghai Jiaotong University School of Medicine,Shanghai 201900,China; 2.Department of Laboratory Medicine,Xinhua Hospital Chongming Branch,Shanghai Jiaotong University School of Medicine,Shanghai 202150,China.
Abstract:
Keywords:gastric cancer   hnRNP K   microRNA   chip   TCGA database   miR-20a
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