抑制 BHK21细胞 STYK1/NOK基因的转录组分析 #br#

目的 转录组分析抑制丝氨酸-苏氨酸-酪氨酸激酶 1（STYK1/NOK）后仓鼠肾正常细胞 BHK21的基因表 达，并分析其可能作用的信号通路。方法 BHK21细胞分为空载体组（转染 6 µg空载体 pBs/U6）、低转染浓度组（2 µg si-STYK1/NOK质粒+4 µg空载体 pBs/U6）和高转染浓度组（6 µg si-STYK1/NOK质粒）。转染 48 h后，Western blot 检测 STYK1/NOK蛋白表达，基于检测结果，选取空载体组和高转染浓度组提取总 RNA进行转录组测序。将测序所 得的序列进行过滤比对，获得差异表达基因后，应用 R软件进行生物功能（GO）分析和 KEGG信号通路分析。应用 STRING蛋白质互作数据库中的互作关系进行差异基因蛋白互作网络的分析。采用 qRT-PCR验证关键差异表达基 因亚甲基四氢叶酸脱氢酶 2（Mthfd2）、转录激活因子 5（Atf5），ⅡA分泌型磷脂酶 A2（Pla2g2a）、6-磷酸果糖-2-激酶/ 果糖-2,6-双磷酸酶 3（Pfkfb3）的表达。CCK-8法检测空载体组和高转染浓度组细胞增殖情况。结果 Western blot 结果表明高转染浓度组明显抑制 STYK1/NOK蛋白表达。高转染浓度组与空载体组相比，共发现差异表达基因 44 个，包括 19个上调基因和 25个下调基因。GO富集分析发现差异表达基因主要影响生物调控、细胞进程、代谢调控、 细胞生物过程、细胞、细胞部分、胞外区、配体和催化活性。KEGG通路分析发现差异表达基因主要集中作用于免疫 系统、癌症、细胞周期、信号转导和氨基酸代谢等方面。qRT-PCR结果表明，高转染浓度组Mthfd2、Atf5的相对表达量 显著上调（P＜0.05），Pfkfb3、Pla2g2a的相对表达量显著下调（P＜0.05），与测序结果相一致。细胞增殖实验表明高转 染浓度组细胞增殖明显高于空载体组（P＜0.01）。结论 抑制 BHK21细胞 STYK1/NOK表达后，致使 BHK21细胞原 癌基因表达增强，抑癌基因表达减少，促进细胞增殖。