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抑制lrp16基因表达药物的生物信息学筛查
引用本文:迟小华,刘丽宏,卢学春,杨波,董蒙. 抑制lrp16基因表达药物的生物信息学筛查[J]. 中国实验血液学杂志, 2009, 17(4): 953-956
作者姓名:迟小华  刘丽宏  卢学春  杨波  董蒙
作者单位:1. 解放军第262医院药剂科,北京,100800
2. 中国人民解放军总医院老年血液科,北京,100853
基金项目:国家自然科学基金资助项目;编号30772597、30873086 
摘    要:本研究通过分析lrp16基因启动子的DNA序列,在负性调控功能区内寻找顺式元件,为筛选有抑制lrp16基因表达的药物奠定基础。以人类基因组数据库和计算机互联网为平台,钓取lrp16基因5’侧翼区3000bp非编码DNA序列和mRNA序列中的ORF序列;利用TESS和Genomax等在线启动子分析软件在人类转录因子数据库中搜索可能存在的顺式结构;利用SAGE和GEO数据库对影响lrp16基因表达的相关药物作用进行分析。结果发现,lrp16基因在长度为3000bp的启动子区内,在负向表达调控区域存在多个顺式结构,其中包括T—Ag、Pu.1、c—Ets、XPF-1、AP2αA、IL6-6RE和RAR。培养的体外细胞系在激素类物质皮质酮、他莫昔芬、毛喉素或去氧肾上腺素、炎性细胞因子IL4或TNFα或化疗药物5-氟尿嘧啶的作用下,lrp16基因的表达水平明显下降。结论:T—Ag、PU.1、c—Ets、XPF-1、AP2αA、IL6—6RE和RAR等转录因子可能抑制lrp16基因的表达;激素类物质皮质酮、他莫昔芬、毛喉素或去氧肾上腺素,炎性细胞因子IL6、IL4或TNFα,或化疗药物5-氟尿嘧啶可能具有抑制lrp16基因表达的作用。

关 键 词:lrp16基因  生物信息学  白血病

Bioinformatics Scan of Factors with Inhibitory Effect on lrp16 Gene Expression
CHI Xiao-Hua,LIU Li-Hong,LU Xue-Chun,YANG Bo,DONG Meng. Bioinformatics Scan of Factors with Inhibitory Effect on lrp16 Gene Expression[J]. Journal of experimental hematology, 2009, 17(4): 953-956
Authors:CHI Xiao-Hua  LIU Li-Hong  LU Xue-Chun  YANG Bo  DONG Meng
Affiliation:(Department of Pharmacy, 262th Hospital of PLA, Beijing 100800, China ; 1 Department of Geriatric Hematology, Chinese PLA General Hospital, Beijing 10085, China)
Abstract:
Keywords:lrp16 gene  bioinformatics  leukemia
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