改进的势能曲面变平法在二维非格点模型中的应用 |
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引用本文: | 刘景发,陈端兵,刘朝霞.改进的势能曲面变平法在二维非格点模型中的应用[J].中国药品标准,2008(10). |
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作者姓名: | 刘景发 陈端兵 刘朝霞 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,湖南省教育厅青年基金 |
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摘 要: | 蛋白质结构预测问题是生物信息学中的一个重要问题.缺少一种有效的全局寻优方法是阻碍这一问题解决的关键.势能曲面变平(ELP)法是一种启发式的全局优化方法,是一种推广的Monte Carlo方法,已成功地应用于许多优化问题.在ELP法的基础上,提出了改进的势能曲面变平(ELP )算法.将ELP 算法应用于二维非格点的蛋白质AB模型,预测和发现四条链长分剐为13,21,34和55的氨基酸序列的蛋白质结构.数值实验表明,ELP 算法是一种预测蛋白质结构的有效算法.
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关 键 词: | 蛋白质结构预测 非格点模型 Monte Carlo方法 ELP方法 |
Improved Energy Landscape Paving Method and its Application in 2D Off-lattice Model |
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Authors: | LIU Jing-f CHEN Duan-bing LIU Zhao-xia |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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