| 应用DNA微阵列技术快速鉴定分枝杆菌菌种 |
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| 引用本文： | 张俊仙,吴雪琼,邢婉丽,张琼,梁建琴,张洪恩,陆阳.应用DNA微阵列技术快速鉴定分枝杆菌菌种[J].中国防痨杂志,2007,29(1):1-7. |
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| 作者姓名： | 张俊仙 吴雪琼 邢婉丽 张琼 梁建琴 张洪恩 陆阳 |
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| 作者单位： | [1]解放军总医院第二附属医院,北京100091 [2]生物芯片北京国家工程研究中心,北京102206 |
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| 基金项目： | “十五”国家重大科技专项“功能基因组和生物芯片”科研基金和军队医学杰出中青年人才科研基金项目（01J020）志谢：感谢河北省胸科医院张广宇、福州肺科医院张丽水、上海省肺科医院乐军为本实验提供菌株. |
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| 摘 要： | 目的 利用DNA微阵列的高通量、高效性,建立一种快速、简便的分枝杆菌分子菌种鉴定方法,为临床医师正确诊断提供依据.方法 以DNA直接测序法为对照,通过PCR-SSCP和DNA微阵列技术分析28种分枝杆菌标准菌株、9种非分枝杆菌和465株分枝杆菌临床分离株的菌种.结果 应用DNA微阵列技术分析28种分枝杆菌标准菌株和9种非分枝杆菌菌株,特异性100%.465株分枝杆菌临床分离株中,经16S rRNA PCR-SSCP初步菌种鉴定,256株为结核分枝杆菌复合群,应用DNA微阵列分析,显示与分枝杆菌属探针M和结核分枝杆菌复合群探针a杂交阳性,两种鉴定方法结果一致;209株PCR-SSCP初步鉴定为非结核分枝杆菌的分离株,经芯片分析,68株为龟分枝杆菌龟亚种和脓肿亚种,46株为胞内分枝杆菌,34株为堪萨斯、瘰疬、胃和猿猴分枝杆菌复合群,31株为偶然分枝杆菌,16株为戈登分枝杆菌,3株为鸟分枝杆菌,2株为海和溃疡分枝杆菌复合群,1株为土分枝杆菌,1株为迪氏分枝杆菌,1株为草分枝杆菌;另6株只与探针M杂交,经测序显示5株为胞内分枝杆菌,但其基因序列与标准菌株不完全相同,1株为新金色分枝杆菌,芯片上无鉴定该菌种的探针.结论 用DNA微阵列可简便、快速、灵敏、特异地将大多数分枝杆菌鉴定到种,提高分枝杆菌病的正确诊断率,指导临床合理治疗.
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| 关 键 词： | 分枝杆菌 聚合酶链反应 单链构象多态性 菌种鉴定 DNA微阵列 |
| 修稿时间： | 2006-01-16 |
Rapid identification of Mycobacterium species by DNA chip |
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| Zhang Junxian , Wu Xueqiong , Xing Wanli ,et al..Rapid identification of Mycobacterium species by DNA chip[J].The Journal of The Chinese Antituberculosis Association,2007,29(1):1-7. |
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| Authors: | Zhang Junxian Wu Xueqiong Xing Wanli |
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| Institution: | The 2 nd Affilliated Hospital of PLA General Hospital, Beijing 100091, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Mycobacterium Polymerase chain reaction Single-stranded conformation polymorphism Species identification DNA chip |
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