| 基于转录组学探讨蚕梅方抗结直肠癌的作用机制 |
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| 引用本文： | 郭翠,徐祎敏,韩馨悦,刘晓强,解润南,孟祥雪,付晓伶. 基于转录组学探讨蚕梅方抗结直肠癌的作用机制[J]. 上海中医药杂志, 2022, 0(2): 54-60 |
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| 作者姓名： | 郭翠 徐祎敏 韩馨悦 刘晓强 解润南 孟祥雪 付晓伶 |
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| 作者单位： | 辽宁中医药大学研究生院;上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院肿瘤二科;上海市静安区市北医院疼痛科;上海市宝山区庙行镇社区卫生服务中心 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年基金项目(81403360);上海市体育科技备战攻关计划项目(20J019);上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院重点项目(2019YYZ08)。 |
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| 摘 要： | 目的利用二代测序技术探讨蚕梅方在转录组学层面上抗结直肠癌活性的作用机制。方法将来源于《本草纲目》中治疗肠风的核心药物乌梅及僵蚕组方为蚕梅方,对RKO细胞(肠癌细胞)进行干扰,采用二代高通量测序平台(Illumina HiSeq)测序技术分别对对照组(RKO-control)和实验组(RKO-treatment)进行高通量转录组测序,并应用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行生物功能富集分析,通过分子对接方法验证活性成分与关键靶点的结合作用。结果差异基因数为2 516个,其中上调基因1 279个,下调基因1 237个,筛选得到叉头框蛋白D1(FOXD1)、腓骨蛋白2(FBLN2)、低密度脂蛋白受体A类结构域2(LDLRAD2)三个与结直肠癌相关的核心差异基因。GO分析发现,差异基因主要涉及单体代谢过程、细胞周期过程以及对有机物质的调控等过程;KEGG分析发现,差异表达基因主要涉及代谢途径、细胞周期和RNA转运等信号通路,分子对接验证了蚕梅方主要活性化合物与核心靶点有较高的结合活性。结论蚕梅方可能通过多靶点、多途径的作用方式,从基因的转录表达、细胞代谢和凋亡等方面发...
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| 关 键 词： | 蚕梅方 结直肠癌 转录组学 代谢通路 高通量测序平台 中药研究 |
Mechanism of Canmei Formula against colorectal cancer based on transcriptomics |
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| GUO Cui,XU Yimin,HAN Xinyue,LIU Xiaoqiang,XIE Runnan,MENG Xiangxue,FU Xiaoling. Mechanism of Canmei Formula against colorectal cancer based on transcriptomics[J]. Shanghai Journal of Traditional Chinese Medicine, 2022, 0(2): 54-60 |
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| Authors: | GUO Cui XU Yimin HAN Xinyue LIU Xiaoqiang XIE Runnan MENG Xiangxue FU Xiaoling |
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| Affiliation: | (Graduate School,Liaoning University of Traditional Chinese Medicine,Shenyang,Liaoning 110847,China;Second Department of Oncology,Yueyang Hospital of Integrated Traditional Chinese and Western Medicine,Shanghai University of Traditional Chinese Medicine,Shanghai 200437,China;Department of Pain,Shibei Hospital,Jing’an District,Shanghai 200435,China;Community Health Service Center of Miaohang Town,Baoshan District,Shanghai 200443,China) |
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| Abstract: | |
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