质谱SARAMIS软件比对分析功能快速筛查高毒力肺炎克雷伯菌的效果评估 |
| |
引用本文: | 王惠,温海楠,张宗伟,闫妹姝,张盼,梁悦怡,刘焱超,谢守军. 质谱SARAMIS软件比对分析功能快速筛查高毒力肺炎克雷伯菌的效果评估[J]. 临床检验杂志, 2022, 40(11): 857-862 |
| |
作者姓名: | 王惠 温海楠 张宗伟 闫妹姝 张盼 梁悦怡 刘焱超 谢守军 |
| |
作者单位: | 承德医学院附属医院南区检验科 |
| |
基金项目: | 承德市科技计划项目( 201804A082)。 |
| |
摘 要: | 目的 评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)SARAMIS软件快速区分高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)与经典肺炎克雷伯菌(cKP)的能力。方法 收集2020年11月—2021年10月承德医学院附属医院临床分离非重复肺炎克雷伯菌(KP)共199株,采用MALDI-TOF MS技术对KP菌株进行鉴定。PCR扩增peg-344、rmpA和iucA毒力基因,以上述3种基因同时检测阳性作为hvKP区别于cKP的诊断标准。随机取其中90株KP分为hvKP(47株)组和cKP(43株)组,建立快速鉴别hvKP和cKP的筛选模型。菌株经梅里埃质谱仪检测并采集蛋白质图谱,收集两组细菌的蛋白质图谱导入质谱科研库SARAMIS软件进行修饰放大比对分析,肉眼观察上述图谱筛选出有明显差异的蛋白质峰,分别计算有差异的质荷比处蛋白质峰面积(area, A)与强度(intensity, I)的比值(A/I值)。将两组细菌的A/I值导入SPSS 26.0软件进行统计分析,利用受试者工作特征(ROC)曲线评估上述有统计学差异A/I值的临床诊断效果。采取盲法对另外109株菌株进行验证研究,评价A/I...
|
关 键 词: | 高毒力肺炎克雷菌 经典肺炎克雷伯菌 毒力基因 质荷比蛋白质峰峰面积/强度 质谱仪 SARAMIS软件 |
收稿时间: | 2022-08-06 |
Efectiveness evaluation for rapid screening of hy pervirulent Kleb siella pneu moniae by comparison analysis of MS SARAM IS .software |
| |
Abstract: | |
| |
Keywords: | Key words: hypervirulent Klebsiella pneumoniae classical Klebsiella pneumoniae virulence gene area/ intensity value of mass to charge protein peak mass spectrometer SARAMIS sofware |
|
| 点击此处可从《临床检验杂志》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《临床检验杂志》下载全文 |