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靶向PV株核蛋白基因的小分子干扰RNA对不同狂犬病病毒毒株复制的交叉抑制作用
引用本文:王继麟,朱家鸿,徐葛林. 靶向PV株核蛋白基因的小分子干扰RNA对不同狂犬病病毒毒株复制的交叉抑制作用[J]. 中国医药生物技术, 2008, 3(3): 204-209
作者姓名:王继麟  朱家鸿  徐葛林
作者单位:武汉生物制品研究所,430060
摘    要:目的研究小分子干扰RNA(siRNA)对狂犬病病毒(RV)不同毒株复制的交叉抑制效果。方法采用体外转录和RNA酶Ⅲ消化长片段双链RNA的方法制备8条以RV的PV株核蛋白(N)基因为靶基因的21nt siRNA,用以转染已经感染了不同滴度PV、CTN或CVS株RV的BSR细胞,采用直接免疫荧光法观察转染的siRNA对已感染BSR细胞的不同毒株RV复制的抑制效果,并分析这种抑制效果与靶基因序列的相关性。结果不同21nt siRNA均对PV株的复制产生了较强的抑制作用:对CTN株和CVS株的交叉抑制作用观察结果表明,21nt siRNA与靶基因在碱基错配高达5个的情况下仍对病毒复制保持抑制效应。然而,siRNA与靶基因碱基错配的位置与抑制作用的丧失高度相关。3’端第2个碱基的错配将使抑制作用表失,随后的碱基错配对抑制作用的影响依次降低;中部碱基错配影响较小;而5’端碱基错配对抑制作用几乎没有影响。结论siRNA对靶基因的抑制作用的丧失与其同靶基因序列碱基错配的位置相关,3’端碱基错配可降低其抑制作用的特异性,产生偏靶效应的范围和概率可能增大,这为设计独特的siRNA序列提供了新的思路。

关 键 词:狂犬病病毒  RNA  小分子干扰  病毒  复制  碱基错配
收稿时间:2008-01-29

Cross-inhibitory effect of small interfering RNA complementary to rabies virus PV strain N gene on replication of different rabies virus strains
WANG Ji-lin,ZHU Jia-hong,XU Ge-lin. Cross-inhibitory effect of small interfering RNA complementary to rabies virus PV strain N gene on replication of different rabies virus strains[J]. Chinese Medicinal Biotechnology, 2008, 3(3): 204-209
Authors:WANG Ji-lin  ZHU Jia-hong  XU Ge-lin
Affiliation:(Rabies virus; RNA, small interfering; Virus replication; Base pair mismatch)
Abstract:
Keywords:Rabies virus  RNA, small interfering  Virus replication  Base pair mismatch
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