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基因芯片技术检测10种烈性RNA病毒
引用本文:杨银辉,杨瑞馥,常国辉,司炳银,翟俊辉,吕富双,周东生,韩伟国,祝庆余. 基因芯片技术检测10种烈性RNA病毒[J]. 解放军医学杂志, 2006, 31(3): 203-206
作者姓名:杨银辉  杨瑞馥  常国辉  司炳银  翟俊辉  吕富双  周东生  韩伟国  祝庆余
作者单位:100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室;100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室;100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室;100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室;100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室;100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室;100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室;100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室;100071,北京,军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室
摘    要:目的 利用基因芯片技术检测包括披膜病毒科甲病毒属、黄病毒科黄病毒属、布尼亚病毒科汉坦病毒属及SARS病毒等10种烈性RNA病毒。方法 设计了甲病毒属的属保守区通用引物和黄病毒属的通用引物,与布尼亚病毒及SARS病毒的引物一起用于扩增靶核酸。另外,在通用引物所能扩增的区域内设计每种病毒的特异引物,利用该引物通过PCR反应制备cDNA克隆探针,在判定其特异性后,制备氨基化探针。对探针浓度、杂交温度、杂交时间、不同杂交液及杂交后芯片的洗涤方法进行了优化。结果核酸探针浓度为0.3ug/ul时,可获得杂交信号;在杂交液终浓度含20%甲酰胺、杂交60℃、1.5h的条件下,可分别获得以上10种病毒的特异杂交信号。利用多重PCR扩增靶序列时,可获得2种或4种混合病原体的特异性杂交信号。结论 利用基因芯片技术检测病毒性病原体是可行的,关键在于设计合适的引物及探针序列。

关 键 词:寡核苷酸序列分析RNA  病毒  检测
收稿时间:2005-09-07
修稿时间:2005-12-26

The detection of 10 violent RNA viruses by microarray technology
Yang Yinhui, Yang Ruifu, Chang Guohui et al.. The detection of 10 violent RNA viruses by microarray technology[J]. Medical Journal of Chinese People's Liberation Army, 2006, 31(3): 203-206
Authors:Yang Yinhui   Yang Ruifu   Chang Guohui et al.
Affiliation:State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Academy of Military Medical Sciences, Beijing 100071, China
Abstract:
Keywords:oligonucleotide array sequence analysis   RNA, viral   detection  
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