基于16S rRNA测序分析脂多糖结合蛋白基因敲除对小鼠肠道菌群的影响 |
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引用本文: | 张振宇,米传靓,李思迪,郭中坤,陈志达,王可洲.基于16S rRNA测序分析脂多糖结合蛋白基因敲除对小鼠肠道菌群的影响[J].中国医药生物技术,2023(2):110-115. |
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作者姓名: | 张振宇 米传靓 李思迪 郭中坤 陈志达 王可洲 |
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作者单位: | 山东第一医科大学(山东省医学科学院)实验动物学院(省实验动物中心) |
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基金项目: | 山东省重点研发计划(软科学项目)(2021RZB01006);;山东省医药卫生科技发展计划(2019WS177); |
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摘 要: | 目的 探究脂多糖结合蛋白基因(Lbp)敲除对小鼠肠道菌群结构的影响。方法 随机选取8只Lbp-/-小鼠作为Lbp-/-组,8只WT小鼠作为WT组。处死小鼠,解剖后取盲肠并编号,进行16S rRNA测序,采用OTU聚类分析、Alpha多样性分析、Beta多样性分析、门水平和属水平差异分析等方法分别对两组小鼠肠道菌群的丰度、多样性和物种组成进行研究。结果 与WT组相比,Lbp-/-组小鼠在门水平上,拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度显著升高,柔膜菌门(Tenericutes)、厚壁菌门(Firmicutes)等相对丰度显著降低;在属水平上,拟杆菌属(Bacteroides)、普氏菌属(Prevotella)等相对丰度显著升高,Ⅳ梭菌属(Clostridium Ⅳ)、双歧杆菌属(Olsenella)等相对丰度显著降低。结论 Lbp敲除后拟杆菌属和普氏菌属丰度显著升高,这两类菌与多种肠道炎症性疾病密切相关,这为临床检测炎症相关疾病发生发展提供参考。
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关 键 词: | 脂多糖结合蛋白 炎症 16S rRNA 肠道菌群 |
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