二代测序技术检测儿童急性淋巴细胞白血病的基因突变谱及其预后意义

目的分析儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）的基因突变谱及其预后意义。方法回顾性分析2016年11月至2019年12月福建医科大学附属协和医院采用二代测序技术（NGS）行基因突变检测的141例初治ALL患儿的临床资料，分析基因突变谱及其对ALL患儿预后的影响。结果141例患儿中，83例（58.9％）检出体细胞突变，包括37个Ⅰ类及123个Ⅱ类突变位点。单核苷酸变异（SNV）为最常见的突变类型。KRAS（20/160，12.5％）为最常见的突变基因，其次为NOTCH1（11.9％）及NRAS（10.6％）。RAS通路（KRAS、FLT3、PTPN11）、PAX5及TP53突变仅在B-ALL患儿中检出，而FBXW7、PTEN突变仅在T-ALL患儿中检出；NRAS突变主要在B-ALL中检出，而NOTCH1突变主要在T-ALL中检出。每例T-ALL患儿检出的平均基因突变个数显著高于B-ALL患儿（4.16±1.33对2.04±0.92，P＝0.004）。按照有无遗传变异将患儿分为突变组和无突变组，两组的性别、年龄、初诊白细胞计数、微小残留病监测结果、预计3年无事件生存（EFS）率及总生存（OS）率差异均无统计学意义（P值均>0.05）；但突变组T-ALL以及融合基因阴性患儿的比例显著高于无突变组（P值分别为0.021和<0.001）。进一步亚组分析，在融合基因阴性的患儿中，有Ⅰ类突变的患儿预计3年EFS率显著低于无Ⅰ类突变的患儿（85.5％对100.0％，P＝0.039）；在B-ALL患儿中，伴TP53突变的患儿预计3年EFS率显著低于不伴有TP53突变的患儿（37.5％对91.2％，P<0.001）。结论体细胞突变在儿童ALL中较为常见，与临床表型及预后具有一定的相关性，NGS可作为传统MICM分型检查的重要补充。