子痫前期孕妇胎盘组织中circRNA表达谱及circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络分析题录 |
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引用本文: | 廖灵蕴,刘敏,张燕萍,尹杨雪,魏晓红,高林波,周容.子痫前期孕妇胎盘组织中circRNA表达谱及circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络分析题录[J].中华妇产科杂志,2023(6). |
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作者姓名: | 廖灵蕴 刘敏 张燕萍 尹杨雪 魏晓红 高林波 周容 |
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作者单位: | 1. 四川大学华西第二医院妇产科 出生缺陷与相关妇儿疾病教育部重点实验室 国家卫生健康委员会时间生物学重点实验室;2. 四川大学华西第二医院分子与转化医学实验室 |
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基金项目: | 国家重点研发计划(2021YFC2701601);;国家自然科学基金(81871175); |
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摘 要: | 目的通过高通量测序鉴定子痫前期(PE)孕妇胎盘组织中环状RNA(circRNA)的表达谱, 构建circRNA-微小RNA(miRNA)-信使RNA(mRNA)相互作用网络, 揭示PE发病的相关通路及调控机制。方法收集2019年11月至2021年6月在四川大学华西第二医院分娩的42例PE孕妇(PE组)和30例正常妊娠孕妇(对照组)的临床资料并采集其胎盘组织。(1)采用高通量测序技术建立其中5对PE组和对照组孕妇胎盘组织中的差异表达circRNA谱。(2)实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术验证其中6个差异表达circRNA在PE组和对照组胎盘组织中的表达水平。(3)使用生物信息学方法预测靶miRNA和分析共表达mRNA, 构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络;并对差异表达circRNA进行基因本体(GO)功能注释分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。(4)采用logistic回归分析、Pearson相关、Kendall tau-b相关分析检验3个差异表达circRNA与PE发生风险、临床特征的相关性。(5)选择circRNA05393进行后续功...
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关 键 词: | 子痫前期 RNA 环状 微RNAs RNA 信使 胎盘 基因表达谱 高通量核苷酸序列分析 |
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