多疣壁虎断尾后脊髓再生过程中mRNA和微小RNA差异表达谱的分析

目的 分析多疣壁虎断尾后脊髓再生过程中相关mRNA和微小RNA(miRNA)的表达变化，探讨差异表达的mRNA和miRNA在脊髓损伤再生过程中的生物学作用。方法 构建多疣壁虎断尾模型，50只多疣壁虎分为正常组、断尾15 d组和断尾25 d组，每组5只实验重复3次，余5只备用。收集各组标本，提取各组RNA并进行高通量测序。生物信息学分析鉴定组间差异表达的mRNA、miRNA,基因本体论(GO)富集分析差异表达的mRNA功能注释，构建脊髓再生相关的miRNA和mRNA基因调控网络。结果 经测序分析多疣壁虎正常和新生脊髓中mRNA、miRNA的差异表达，断尾15 d组和断尾25 d组分别鉴定到538、510个差异mRNA表达和446、127个差异miRNA表达。GO分析发现，差异表达的mRNA聚集于与细胞增殖、神经发育相关的生物学过程。在脊髓再生相关miRNA及其靶基因调控网络中，断尾15 d组有21个mRNA表达下调，被41个上调的miRNA负向调控；12个mRNA表达上调，受到29个下调的miRNA调控。在断尾25 d组中，8个mRNA表达下调，被10个上调的miRNA负向调控；20个m...