| 北京地区实验动物绿脓杆菌分离株MLVA分型 |
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| 作者姓名： | 邢进 吴军 岳秉飞 贺争鸣 |
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| 作者单位： | 1. 军事医学科学院生物工程研究所,北京100071;中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所,北京100050
2. 军事医学科学院生物工程研究所,北京,100071
3. 中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所,北京,100050 |
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| 摘 要： | 目的 通过多位点可变数目串联重复序列分析(multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis,MLVA)分型方法,研究北京地区实验动物绿脓杆菌分离株基因型和分布情况.方法 选择13个可变数目重复序列(variable-number tandem-repeat,VNTR)位点,对实验动物及设施中检测出的141株绿脓杆菌的基因组DNA进行重复序列扩增,所得指纹图谱使用BioNumerics软件进行聚类分析,绘制系统发育树和最小生成树(minimum spanning tree,MST).结果 所采用的13个VNTR位点能够对全部分离株进行有效分型.141株绿脓杆菌主要被分为了3个基因群,56个基因型.各群所占比例分别为A群82.3％,B群占12.8％,C群占5.0％,辛普森多样性指数为0.763.同一区域内相邻实验动物单位的绿脓杆菌分离株同源关系较远.结论 MLVA方法对绿脓杆菌具有很好的分型能力,能够有效的追踪绿脓杆菌的来源.北京地区实验动物中绿脓杆菌分离株基因型多态性丰富,但无地域性同源关系.
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| 关 键 词： | 绿脓杆菌 多位点可变数目串联重复序列 基因分型 实验动物 |
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