基于数据库分析自噬相关基因与卵巢癌不良预后的关系 |
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引用本文: | 王微微,季瑞,何爱琴.基于数据库分析自噬相关基因与卵巢癌不良预后的关系[J].诊断病理学杂志,2023(3):308-312. |
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作者姓名: | 王微微 季瑞 何爱琴 |
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作者单位: | 南通市肿瘤医院妇科 |
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摘 要: | 基于数据库分析自噬相关的基因与卵巢癌(ovarian cancer, OC)不良预后的关系。通过GEO数据库GSE54388数据集筛选OC中的差异基因,GO数据库分析确认其中与自噬相关的基因,对其进行PPI、KEGG分析,并通过在线数据库确认与OC预后的关系。GSE5438数据集中有910个基因在卵巢癌中存在异常表达,GO分析结果显示其中共计13个基因与自噬相关,分别为CHMP4C、PTK2、LAMP3、HK2、ERN1、DCN、S100A8、SNCA、LGALS8、DAPK1、SYNPO2、GATA4、KDR。差异表达的自噬相关基因的GO和KEGG富集分析显示出与自噬、线粒体自噬相关的几个富集术语。在GEPIA数据库中,PTK2、HK2、S100A8和KDR在OC中无差异表达(P>0.05),而CHMP4C、LAMP3呈高表达(P<0.05),ERN1、DCN、SNCA、LGALS8、DAPK1、SYNPO2、GATA4呈低表达(P<0.05)。此外,高表达DAPK1的OC患者预后总生存率明显降低,这也提示DAPK1与OC的不良预后有关。通过生物学信息分析发现在OC...
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关 键 词: | 生物学信息分析 自噬 卵巢癌 基因表达综合数据集 不良预后 |
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