| 运动损伤滑膜组织转录组数据分析及骨关节炎关键通路和特征基因 |
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| 引用本文： | 付东阁何静子. 运动损伤滑膜组织转录组数据分析及骨关节炎关键通路和特征基因[J]. 中国组织工程研究, 2023, 0(28): 4554-4558 |
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| 作者姓名： | 付东阁何静子 |
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| 作者单位： | 1.延安大学体育学院716000; |
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| 基金项目： | 延安大学博士科研启动基金(YDBK2022-20),项目负责人:付东阁。 |
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| 摘 要： | 背景：研究表明，骨关节炎与滑膜炎密不可分，因此基于滑膜组织探索骨关节炎发病机制具有重要的临床意义。目的：基于生物信息学方法分析骨关节炎患者滑膜组织与正常人滑膜组织转录组数据，从滑膜角度探索骨关节炎的诊疗靶点，并为骨关节炎提供后续研究思路。方法：从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中筛选含有骨关节炎滑膜组织和健康滑膜组织的数据集，得到GSE55457和GSE55235数据集，2个数据集均包含有10个骨关节炎滑膜样本和健康者滑膜样本。用GEO2R在线工具分别对GSE55457和GSE55235数据集进行差异表达分析，取校正后P值(adj.P)<0.05的基因并通过在线工具仙桃学术取2个数据集共同的上调和下调差异表达基因。并对差异基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析。利用STRING数据库对差异基因进行核心蛋白互作网络分析(PPI)，并使用Cytoscape软件中的插件CytoHubba中的7种算法(BottleNeck,Clossness,Degree,DNNC,EPC,NNC和MCC)对STRING结果进行可视化，每种算法取分数最高的前10个基因...
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| 关 键 词： | 骨关节炎 滑膜 生物信息学 差异表达基因 关键基因 治疗靶点 |
Key pathways and hub genes of osteoarthritis based on transcriptome data of sports injury synovial tissue |
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| Fu D.He J.. Key pathways and hub genes of osteoarthritis based on transcriptome data of sports injury synovial tissue[J]. Chinese Journal of Tissue Engineering Research, 2023, 0(28): 4554-4558 |
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| Authors: | Fu D.He J. |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | bioinformatics differentially expressed gene hub gene osteoarthritis synovial membrane therapeutic target |
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