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海南省HIV-1基因亚型分析
引用本文:符鹏,邓巍,鲍琳琳,Nicole Vidal,何启亚,秦川,Martine Peeters,Eric Delapone,王召乾,邝继深,张帆,胡玉銮,卢葳.海南省HIV-1基因亚型分析[J].中国公共卫生,2009,25(9).
作者姓名:符鹏  邓巍  鲍琳琳  Nicole Vidal  何启亚  秦川  Martine Peeters  Eric Delapone  王召乾  邝继深  张帆  胡玉銮  卢葳
作者单位:1. 海南省疾病预防控制中心,海口,570203
2. 北京协和医学院中国医学科学院比较医学中心;北京协和医学院中国医学科学院中法合作艾滋病研究中心
3. 法国发展研究院蒙特利尔大学UMR145研究所
4. 巴黎第五大学肿瘤疫苗免疫治疗中心病毒分子研究所
5. 北京协和医学院中国医学科学院中法合作艾滋病研究中心;法国发展研究院蒙特利尔大学UMR145研究所
摘    要:目的 分析海南省人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)基因亚型,监测HIV毒株的流行状况.方法 从88份HIV-1抗体阳性的血浆中提取RNA,逆转录后采用PCR法扩增HIV-1基因序列中的env及pol基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,经比对分析而确定基因亚型.构建最大似然(ML)进化树,分析感染者间的传播链.结果 88份样品中,有83份样品被扩增出HIV-1的env及pol基因片段;共发现6种HIV-1亚型和重组型,其中CRF01-AE亚型70份,B'亚型8份,C亚型2份,B亚型和CRF08-BC、CRF01-AE/B'重组亚型各1份.在ML进化树上83份样品分成4个传播群(66/83)和非传播群(17/83),其中传播群1最庞大(59/83).结论 海南省HIV/AIDS的HIV-1基因亚型至少有6种,其中CRF01-AE为主要亚型,占84.33%(70/83),主要分布在静脉吸毒者及其性伴侣之间,形成了一个庞大的传播群.其次为B'亚型(9.6%).另外的4种亚型(6%)仅见单个病例.提示海南省静脉吸毒为主要的感染途径(67.5%);经性接触传播的亚型种类复杂多样,包括本次检出的全部亚型和重组株.

关 键 词:人类免疫缺陷病毒  亚型  序列分析  进化树

HIV-gene subtypes in HIV positives and AIDS patients in Hainan province
Nicole Vidal,Martine Peeters,Eric Delapone,Jean-Marie Andrieu.HIV-gene subtypes in HIV positives and AIDS patients in Hainan province[J].Chinese Journal of Public Health,2009,25(9).
Authors:Nicole Vidal  Martine Peeters  Eric Delapone  Jean-Marie Andrieu
Abstract:
Keywords:
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