| 采用分子动力学模拟方法探究Ca~(2+)对VWF-A2结构域稳定性的影响 |
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| 引用本文： | 谢旭斌,刘文平,吴建华,方颖.采用分子动力学模拟方法探究Ca~(2+)对VWF-A2结构域稳定性的影响[J].医用生物力学,2018,33(3):248-254. |
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| 作者姓名： | 谢旭斌 刘文平 吴建华 方颖 |
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| 作者单位： | 华南理工大学生物科学与工程学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（11432006，11672109，11272125，31170887） |
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| 摘 要： | 目的探究Ca~(2+)对VWF-A2结构域稳定性的影响。方法 A2和A2/Ca~(2+)的晶体结构取自PDB数据库。通过恒力拉伸分子动力学模拟,比较分析Ca~(2+)结合引起的构象变化、解折叠路径的差异以及酶切位点的暴露程度。结果 A2结构域的解折叠路径和酶切位点的暴露过程是力依赖的。Ca~(2+)结合不影响A2结构域的前期解折叠,但由于α3β4-环链局部构象重排所致柔性降低,约束了β1-β4-β5片层的运动,导致进一步解折叠受阻而停留在中间稳态,影响酶切位点的充分暴露。结论力可诱导A2结构域中β5片层的解折叠使酶切位点暴露,而Ca~(2+)的结合则通过稳定疏水核心结构,阻碍酶切位点的暴露,最终降低ADAMTS13的酶切效率。研究结果有助于加深对ADAMTS13酶切VWF-A2结构域进而调控VWF止血能力过程的理解,并为相关抗血栓药物设计提供指导。
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| 关 键 词： | 血管性血友病因子 A2结构域 钙离子 分子动力学模拟 解折叠 |
| 收稿时间： | 2017/6/15 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2017/8/8 0:00:00 |
Effects of Calcium on the Stability of VWF-A2 Domain by Molecular Dynamics Simulation |
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| XIE Xubin,LIU Wenping,WU Jianhua and FANG Ying.Effects of Calcium on the Stability of VWF-A2 Domain by Molecular Dynamics Simulation[J].Journal of Medical Biomechanics,2018,33(3):248-254. |
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| Authors: | XIE Xubin LIU Wenping WU Jianhua and FANG Ying |
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| Institution: | School of Bioscience and engineering, South China University of Technology,School of Bioscience and engineering, South China University of Technology,School of Bioscience and engineering, South China University of Technology and School of Bioscience and engineering, South China University of Technology |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Von Willebrand factor A2 domain calcium molecular dynamics simulation unfolding |
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