| 铁皮石斛DoSRK2E基因的克隆与表达分析 |
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| 引用本文： | 张明英,李依民,高静,陈莹,李元敏,王西芳,张岗. 铁皮石斛DoSRK2E基因的克隆与表达分析[J]. 中草药, 2018, 49(21): 4960-4966 |
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| 作者姓名： | 张明英 李依民 高静 陈莹 李元敏 王西芳 张岗 |
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| 作者单位： | 陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西西安 712046,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西西安 712046,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西西安 712046,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西西安 712046,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西西安 712046,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西西安 712046,陕西中医药大学药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室, 陕西西安 712046 |
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| 基金项目： | 陕西省教育厅科学研究计划项目（18JK0221）；陕西中医药大学2017年博士科研启动经费（104080001）；陕西省高校青年杰出人才支持计划项目；咸阳市中青年科技领军人才项目 |
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| 摘 要： | 目的克隆铁皮石斛蔗糖非酵解1型相关蛋白激酶2(Sn RK2)家族基因,并进行生物信息学和表达分析。方法通过RT-PCR、RACE克隆铁皮石斛Sn RK2(DoSRK2E)基因c DNA全长,利用生物信息学软件预测基因编码蛋白的相对分子质量、等电点、结构域、跨膜结构、信号肽及亚细胞定位等;利用DNASTAR和MEGA进行多序列比对和系统发育关系重建分析;利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测基因组织表达模式。结果获得铁皮石斛DoSRK2E基因(GenBank登录号API65110),cDNA全长1 795 bp,包含1个1 086 bp的完整开放阅读框,编码蛋白相对分子质量40 850,等电点4.80,无信号肽和跨膜域,包含1个蛋白激酶结构域、1个ATP结合位点和1个Ser/Thr蛋白激酶活化位点,预测定位在内质网膜上;DoSRK2E蛋白与植物SnRK2蛋白序列高度一致,系统发育位置位于SnRK2亚家族的分支III,与拟南芥At SnRK2.6的亲缘关系最近;DoSRK2E基因在铁皮石斛根中表达量最高,茎中次之,叶中最低。结论首次从珍稀濒危药用植物铁皮石斛中克隆得到SnRK2家族基因DoSRK2E,对其分子特性与组织表达模式进行了分析研究,为进一步揭示该基因在铁皮石斛逆境胁迫中的作用机制提供基础。
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 蛋白激酶 克隆 表达 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2018-05-16 |
Cloning and expression analysis of gene DoSRK2E in Dendrobium officinale |
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| ZHANG Ming-ying,LI Yi-min,GAO Jing,CHEN Ying,LI Yuan-min,WANG Xi-fang and ZHANG Gang. Cloning and expression analysis of gene DoSRK2E in Dendrobium officinale[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2018, 49(21): 4960-4966 |
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| Authors: | ZHANG Ming-ying LI Yi-min GAO Jing CHEN Ying LI Yuan-min WANG Xi-fang ZHANG Gang |
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| Affiliation: | Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China,Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China and Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research, College of Pharmacy, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi''an 712046, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrobium officinale Kimura et Migo protein kinase clone expression bioinformatic analysis |
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