先天性巨结肠肠管lncRNA-mRNA共表达谱芯片初步筛查研究

目的：研究先天性巨结肠（Hirschsprung’s disease，HD）病变段肠管与正常段肠管lncRNA-mRNA表达谱的差异。方法：采用lncRNA-mRNA共表达谱芯片筛查5例HD肠管和5例配对的正常肠管差异表达的lncRNA和mRNA，并以17对样本对其中显著差异的5个lncRNA进行qRT-PCR验证，同时应用生物信息学的方法构建lncRNA-mRNA共表达网络，预测差异lncRNA的靶基因，并对预测的靶基因进行基因本体论（gene ontology，GO）分析和通路（pathway）分析。结果：lncRNA-mRNA共表达谱芯片筛查出HD肠管中存在353个表达上调，474个下调的lncRNA，以及865个上调，461个下调的mRNA。并验证出5个差异表达的lncRNA。lncRNA与mRNA相互关联，通过调控相应的靶mRNA，参与包括细胞增殖、分化和迁移等多种生物学过程，与HD的发病有一定相关性。结论：HD肠管中存在大量差异表达的lncRNA和mRNA。lncRNA和mRNA之间具有广泛的联系，形成共表达网络，lncRNA可能是通过调控相应的靶mRNA参与HD的发病。