| SARS冠状病毒N蛋白HLA-A*0201限制性CTL表位的预测 |
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| 引用本文： | 王晴,周芙蓉,吴玉章. SARS冠状病毒N蛋白HLA-A*0201限制性CTL表位的预测[J]. 免疫学杂志, 2004, 20(2): 86-90 |
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| 作者姓名： | 王晴 周芙蓉 吴玉章 |
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| 作者单位： | 第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,400038;第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,400038;第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,400038 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展规划项目资助(2003CB514108) |
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| 摘 要： | 目的 预测SARS冠状病毒N蛋白的HLA—A^*0201限制性CTL表位。方法 用人工神经网络和量化矩阵相结合的方法预测出HLA—A^*0201结合肽，再用蛋白酶体矩阵法从中筛选出CTL表位。结果 预测出了6个九肽CTL表位。结论 通过对SARS冠状病毒N蛋白抗原CTL表位进行预测，从而为SARS冠状病毒N蛋白之CTL表位的实验探测和鉴定提供了线索，为认识SARS冠状病毒的免疫保护和免疫病理机制及疫苗的研制提供了基础资料。
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| 关 键 词： | N蛋白 HLA CTL表位 人工神经网络 量化矩阵 蛋白酶体矩阵 |
| 文章编号： | 1000-8861(2004)02-0086-05 |
| 修稿时间： | 2003-09-25 |
Prediction of HLA-A*0201-restricted CTL epitopes in SARS-CoV N protein |
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| WANG Qing,ZHOU Fu-rong,WU Yu-zhang. Prediction of HLA-A*0201-restricted CTL epitopes in SARS-CoV N protein[J]. Immunological Journal, 2004, 20(2): 86-90 |
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| Authors: | WANG Qing ZHOU Fu-rong WU Yu-zhang |
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| Abstract: | Objective To predict the HLA-A *0201-restricted CTL epitopes(Nonamers) in SARS-CoV N protein. Methods A hybrid approach based on combination of artificial neural network(ANN) and quantitative matrix(QM) was employed to predict the HLA-A *0201 restricted CTL epitopes in SARS-CoV N Protein. Then, the proteasomal matrices were used to refine the predicted CTL epitopes. Results Six HLA-A *0201-restricted CTL epitope candidates were predicted in SARS-CoV N protein. Conclusion The prediction of the CTL epitopes in SARS-CoV N protein will benefit the identification of CTL epitopes by experiment. Those results are of importance for immune recognition and vaccine design for SARS-CoV. |
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| Keywords: | N protein HLA CTL epitope Artificial neural network Quantitative matrix Proteasomal matrices |
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