基于转录组测序筛选鹿茸胸腺素促成骨细胞增殖基因

目的 对Tβ4蛋白处理组和空白组进行转录组测序,筛选Tβ4蛋白处理后促成骨细胞相关的候选基因和通路。方法通过Fmoc固相合成法体外合成梅花鹿Tβ4蛋白,并处理MC3T3细胞,CCK8法检测细胞活性。将细胞分为空白组和Tβ4处理组,利用Illumina平台进行高通量测序。对差异表达基因进行GO功能富集分类和KEGG通路分析,构建差异基因的蛋白互作网络并筛选Hub基因,通过在线软件对Hub基因进行富集分析。结果 Tβ4蛋白处理成骨细胞显著促进了细胞的增殖活性。获得差异基因6 106个,其中上调基因1 979个,下调基因4 127个。根据PPI网络中的节点连通度,得到10个Hub基因,其中,筛选到7个与成骨细胞增殖相关的候选基因,分别为CDC20、PLK1、CDK1、BUB1B、BUB1、MAD2L1、RRM2,这些基因富集到了细胞周期信号通路和p53信号通路。结论 梅花鹿Tβ4蛋白处理后可以提高细胞的增殖活性和存活率。梅花鹿胸腺素Tβ4可能是通过调控细胞周期信号通路和p53信号通路中的关键基因达到促进成骨细胞增殖的功能。