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大肠埃希菌O157:H7Tir基因的生物信息学分析
引用本文:王玲,龙北国,胡黎平,罗军,陈健文,范宏英.大肠埃希菌O157:H7Tir基因的生物信息学分析[J].广东寄生虫学会年报,2009(5):506-509,520.
作者姓名:王玲  龙北国  胡黎平  罗军  陈健文  范宏英
作者单位:[1]南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系,广州510515 [2]中山大学基础医学实验教学中心,广州510080 [3]中山大学药学院,广州510080
基金项目:基金项目:广州市科技攻关项目(No.200723-E0391).
摘    要:目的扩增和测序肠出血型大肠埃希菌O157:H7 tir打基因,利用生物信息学预测分析其结构和功能特征.以探讨Tir作为疫苗候选抗原的可能性。方法利用PCR技术扩增fir基因并测序,应用生物信息学网站在线分析工具和vectorNTISUite软件分析Tir蛋白结构和生物学功能,预测B细胞抗原表位。结果该基因全长1674bp,编码558个氨基酸,蛋白质总体亲水性高,有稳定的理化性质。含有3个结构和功能域,两段穿膜结构,多个磷酸化位点,预测20个B细胞线性表位。结论Tir毒力因子是很有前景的疫苗候选抗原,为肠出血型大肠埃希菌O157:H7的疫苗研究提供了理论依据。

关 键 词:出血型大肠埃希菌O157:H7  转位紧密粘附素受体  生物信息学
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