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华支睾吸虫成虫CsRPEF基因的生物信息学分析
引用本文:范为,詹苗,张咏莉.华支睾吸虫成虫CsRPEF基因的生物信息学分析[J].广东寄生虫学会年报,2009(2):168-170.
作者姓名:范为  詹苗  张咏莉
作者单位:[1]广州医学院附属肿瘤医院,广州510095 [2]广东药学院基础学院,广州510224
基金项目:广东省重大科技专项资助项目(No.2004A30801004).
摘    要:目的筛选华支睾吸虫的功能基因并进行相应的生物信息学分析。方法使用PCGENE软件、Antheprot-5软件、ExPAsv在线分析工具、NCBI上的Blastx程序进行华支睾吸虫RNA聚合酶Ⅱ延长因子(CsRPEF)基因的生物信息学分析。结果获得了CsRPEF基因的序列特征,推测到了CsRPEF的同源蛋白并预测出CsRPEF编码蛋白的分子量、等电点、柔曲性、疏水性、功能性位点等二级结构特征。结论华支睾吸虫成虫CsRPEF基因是-新筛选的功能基因,CsRPEF蛋白是可能参与华支睾吸虫基因转录途径的重要因子。CsRPEF基因的生物信息学分析可为其进一步进行生物学功能的实验研究奠定基础。

关 键 词:华支睾吸虫  华支睾吸虫RNA聚合酶Ⅱ延长因子基因  生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of CsRPEF Gene of Clonorchis sinensis
FAN Wei,ZHAN Miao,ZHANG Yong-li.Bioinformatics Analysis of CsRPEF Gene of Clonorchis sinensis[J].Journal of Tropical Medicine,2009(2):168-170.
Authors:FAN Wei  ZHAN Miao  ZHANG Yong-li
Institution:1. Affiliated Tumour Hospital of Guangzhou Medical College, Guangzhou 510095; 2. Department of Medical Biology, Guangdong Pharmaceutical University, Guangzhou 510224, China)
Abstract:
Keywords:clonorchis sinensis  CsRPEF (RNA polymerase Ⅱ elongation factor) gene  bioinformatics
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