基于转录组学数据对肝细胞癌的研究 |
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引用本文: | 杨庆芳.基于转录组学数据对肝细胞癌的研究[J].浙江中西医结合杂志,2021,31(4). |
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作者姓名: | 杨庆芳 |
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作者单位: | 浙江中医药大学附属第二医院 310005 |
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基金项目: | 浙江省中医药科技计划项目(No.2018ZQ022),浙江省康恩贝医院管理软科学研究项目(NO.2017ZHA-KEB205) |
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摘 要: | 目的通过对肝细胞癌的转录组学数据进行分析,为肝细胞癌分子机制研究提供新的证据和思路。方法基于转录组学的肝细胞癌数据,通过t-检验和差异倍数筛选差异表达基因。应用差异表达基因进行基因本体学和信号通路的富集分析,以揭示肝细胞癌发生发展过程中所参与的生物过程及信号通路。结果通过差异表达基因的筛选,共鉴定出486个差异表达基因(其中包括157个上调基因和329个下调基因)。经基因本体学分析和KEGG富集分析,发现肝细胞癌的发病机制主要集中在细胞周期、细胞分裂等生物功能和视黄醇代谢、药物代谢-细胞色素P450、p53等信号通路。结论本研究对探索肝细胞癌的分子标记物和发生发展机制等研究提供了重要的参考信息。
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关 键 词: | 肝细胞癌,转录组,高通量测序,信号通路 |
收稿时间: | 2020/10/16 0:00:00 |
修稿时间: | 2021/3/17 0:00:00 |
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