| 基于加权基因共表达网络分析槲皮素抗胃癌的基因模块和分子标志物研究 |
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| 引用本文： | 张林,欧祥琴,张涛,钟凯,吴学会,李睿思,李青璇,梁峰,张轩.基于加权基因共表达网络分析槲皮素抗胃癌的基因模块和分子标志物研究[J].世界中医药,2021(4):546-552. |
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| 作者姓名： | 张林 欧祥琴 张涛 钟凯 吴学会 李睿思 李青璇 梁峰 张轩 |
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| 作者单位： | 1 天津中医药大学第一附属医院,天津,300193; 2 贵州中医药大学第一附属医院,贵阳,550001; 3 天津中医药大学,天津,301608; 4 香港浸会大学中医药学院,香港,99077 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(81704198)——基于数据挖掘与运气学说的香港地区气象疫病监测预警系统研究 |
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| 摘 要： | 目的:根据加权基因共表达网络(WGCNA)探索槲皮素抗胃癌的潜在生物靶标。方法:利用TCGA数据库下载胃癌相关转录组和临床数据,分析胃癌转录组表达的差异基因,利用网络药理学找到槲皮素的作用靶点,找出槲皮素与胃癌的hub基因。通过KEGG通路,GO基因富集分析寻找hub基因的靶点及通路,探索hub基因的在胃癌临床数据中的生存分析和性状表达的差异。结果:1)共发现槲皮素142个靶点,共139个蛋白质-蛋白质相互作用关系;2)KEGG通路富集分析发现槲皮素抗胃癌的作用通路可能与细胞衰老、MicroRNAs的表达、P53信号通路有关;3)生存分析发现纤溶酶原激活物抑制剂-1(SERPINE1)、微囊蛋白-1(Caveolin-1)、雄性激素受体(AR)、转录因子E2F2(E2F2)、前列腺素E2受体EP3亚型(PTGER3)在胃癌中的表达差异会影响患者的预后(P<0.05);4)在胃癌的TNM分期中,AR与PTGER3的表达差异与胃癌的分期相关(P<0.05);5)GEPIA数据库分析,AR与PTGER3在胃癌组织中的表达存在一定的相关性(P<0.05)。结论:槲皮素抗胃癌机制可能和细胞凋亡、MicroRNAs表达和P53信号通路有关,通过多靶点作用于SERPINE1、CAV1、AR、E2F2、PTGER3,发挥抑制癌细胞,改善患者预后的作用。
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| 关 键 词： | 加权基因共表达网络 胃癌 hub基因 槲皮素 |
| 收稿时间： | 2020/9/11 0:00:00 |
Study on the Mechanism of Quercetin Anti-gastric Cancer Gene Module and Molecular Marker Based on Weighted Gene Co-expression Network |
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| ZHANG Lin,OU Xiangqin,ZHANG Tao,ZHONG Kai,WU Xuehui,LI Ruisi,LI Qingxuan,LIANG Feng,ZHANG Xuan.Study on the Mechanism of Quercetin Anti-gastric Cancer Gene Module and Molecular Marker Based on Weighted Gene Co-expression Network[J].World Chinese Medicine,2021(4):546-552. |
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| Authors: | ZHANG Lin OU Xiangqin ZHANG Tao ZHONG Kai WU Xuehui LI Ruisi LI Qingxuan LIANG Feng ZHANG Xuan |
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| Institution: | (First Teaching Hospital of Tianjin University of Traditional Chinese Medicine,Tianjin 300193,China;The First Affiliated Hospital of Guizhou University of Traditional Chinese Medicine,Guiyang 550001,China;Tianjin University of Traditional Chinese Medicine,Tianjin 301608,China;School of Chinese Medicine,Hong Kong Baptist University,Hong Kong 99077,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Weighted gene co-expression network Gastric cancer Hub genes Quercetin |
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