乙型脑炎病毒减毒活疫苗生产株SA14—14—2基因组全序列的测定

目的：对乙型脑炎减毒活疫苗SA14－14－2生产株进行全序列测定和分析，为进一步了解其基因组结构与疫苗减毒机制的关系及研究疫苗生产的遗传学质控标准奠定基础。方法：根据已发表的SA14－14－2株及SA14株的序列，设计6对相互重叠片段的引物，通过RT－PCR扩增出SA14－14－2疫苗生产株的cDNA片段，分别克隆到pGEM-T载体，转化至TG1受体菌中，挑取阳性克隆进行鉴定后测定全序列。结果：SA14－140－2生产株基因组全序列长10976个核苷酸，96到10394为一个长开放读码框，编码3432个氨基酸。与国外测定的SA14和SA14－14－2株的核苷酸序列和氨基酸序列相比，同源性均在99％以上，突变位点分散于各个区域，以往推测的7个可能与减毒相关的位点均未发生改变。1296－1506间有4个突变位点，有可能作为疫苗质控的遗传学标记。结论：乙脑减毒活疫苗生产株的基因组全序列基本类似于已发表的序列，若干不同位点产生的原因可能在于病毒株的不同传代。全序列的测定对于研究疫苗株的减毒机理及疫苗的遗传学质控标准具有一定意义。

Sequence analysis of the full-length genome of Japanese encephalitis virusvaccine SA14-14-2